Oznaka poročila: ARRS-RPROJ-ZP-2015/114 zaključno poročilo raziskovalnega projekta A. PODATKI O RAZISKOVALNEM PROJEKTU 1.Osnovni podatki o raziskovalnem projektu Šifra projekta J1-4170 Naslov projekta Celična signalizacija Tollu-podobnih receptorjev Vodja projekta 6628 Roman Jerala Tip projekta J Temeljni projekt Obseg raziskovalnih ur 7159 Cenovni razred D Trajanje projekta 07.2011 - 06.2014 Nosilna raziskovalna organizacija 104 Kemijski inštitut Raziskovalne organizacije -soizvajalke 106 Institut "Jožef Stefan" 2992 EN-FIST CENTER ODLIČNOSTI Raziskovalno področje po šifrantu ARRS 1 NARAVOSLOVJE 1.05 Biokemija in molekularna biologija Družbenoekonomski cilj 07. Zdravje Raziskovalno področje po šifrantu FOS 3 Medicinske vede 3.04 Medicinska biotehnologija B. REZULTATI IN DOSEŽKI RAZISKOVALNEGA PROJEKTA 2.Povzetek raziskovalnega projekta1 SLO Tollu podobni receptorji (TLR) predstavljajo družino receptorjev prirojenega imunskega sistema, ki prepoznavajo različne molekularne vzorce značilne za patogene mikroorganizme ali za molekule, ki se sprostijo ob poškodbi tkiva. Aktivacija TLR vodi do vnetja, ki se pojavi pri okužbah, avtoimunskih boleznih, raku in številnih drugih boleznih. Dimerizacija receptorjev TLR sproži aktivacijo signalne poti, ki poteka pri večini TLR preko osrednje adapterske molekule MyD88, ki je sestavljena iz domen smrti (DD), TIR domene ter vmesne INT domene med njima. V projektu smo pojasnili molekulsko vlogo INT domene, ki pomembno sodeluje pri vezavi DD MyD88 na DD kinaze IRAK. Na osnovi peptida INT domene smo pripravili peptide, ki so inhibirali aktivacijo vnetne poti. Pokazali smo, da je dimerizacija TIR domen ključni dogodek v tvorbi Myddosoma in aktivacije signalne poti ter obenem pripravili zelo dobre inhibitorje signalizacije na osnovi dimera TIR domen povezanih preko obvite vijačnice, kar je podobno kot TcpB protein s katerim Brucella zmanjša odziv celice gostitelja na infekcijo. Dizajniran inhibitor je zelo učinkoviti zmanjšal signalizacijo preko TLR5, TLR4, TLR9 ne pa preko TNFR, kar kaže na njegovo dobro selektivnost. Odkrili smo, da se MyD88 preferenčno veže na fosfatidično kislino, ki je pomemben lipidni mediator in odkrili, da fosfatidična kislina in procesi, ki vodijo do njenega povečanja ojačajo aktivacijo preko MyD88. Preko TIR domene se MyD88 veže na dimeriziran receptor TLR ter IL1R. Pred kratkim so odkrili zelo pogosto mutacijo v TIR domeni MyD88 (L265P), ki se pojavlja v difuznem velikoceličnem B-limfomu in pri veliki večini pacientov z Waldenstromovo makroglobulinemijo. Raziskovalci so odkrili, da omenjena mutacija povzroča, da se mutirani proteini povezujejo med seboj, s čimer sprožijo aktivacijo signalnih poti, kar prepreči propad rakastih celic. Raziskali smo vpliv mutacije L265P na signalizacijo ter lastnosti TIR domen. Odkrili smo, da že sama mutirana TIR domena MyD88 sproži aktivacijo, ki je odvisno od prisotnosti endogenega MyD88, kar kaže na to, da lahko pride do povečanja aktivacije tudi v celicah, kjer je mutiran samo en alel. Poleg najbolj pogostih mutacij opisanih v literaturi smo pripravili dodatne umetne mutacije v bližini mutacij povezanih z limfomom ter tako da imajo podobne kemijske lastnosti. Raziskava je pokazala, da so med razvojem raka izbrane prav tiste mutacije, ki omogočijo najmočnejšo aktivacijo in s tem preživetje rakastih celic, ker so bile naravne mutante najbolj aktivne. V publikaciji so pokazali, da lahko rakave celice ubijejo z dodatkom peptida, ki prepreči dimerizacijo MyD88. Raziskava temelji na kombinaciji pristopov molekularne in celične imunologije z molekulskimi simulacijami._ ANG Toll-like receptors (TLR) represent a family of receptors of innate immune system, recognizing different molecular patterns specific to pathogenic microorganisms or molecules which are released by the tissue damage. Activation of TLRs leads to inflammation, which occurs in infections, autoimmune diseases, cancer and many other diseases. Dimerization of receptors TLRs triggers activation of the signaling pathway which takes place in most of the TLR through the central adapter molecule MyD88, which consists of death domain (DD), the TIR domain and an intermediate domain INT between them. In this project, we explain the molecular role INT domain, which is involved in binding of the dD of MyD88 to the DD of kinase IRAK. Based on the peptide INT domain peptides were prepared which inhibited activation of the inflammatory pathway. We have shown that the TIR domain dimerization is a key event in the formation of Myddosom and activation of signaling pathways and prepared efficient inhibitors of signaling based on dimer of TIR domains connected via coiled-coil, which is similar to TcpB Brucella protein which impairs the response of host cells to infection. Designed inhibitor is very effective in decreasing signaling through TLR5, TLR4, TLR9 but not via the TNFR, which indicates its good selectivity. We have discovered that MyD88 preferentially binds to phosphatidic acid, which is an important lipid mediator and discovered that phosphatidic acid and processes increasing its concentration lead to the amplified activation MyD88. Through the TIR domain MyD88 binds to a dimerized receptors TLR and IL1R. Recently a very common mutation in the TIR domain of MyD88 (L265P) has been discovered, which occurs in diffuse large B-cell lymphoma and in the vast majority of patients with Waldenstrom's macroglobulinemia. Researchers have discovered that said mutation causes the mutated proteins to associate with each other, thereby triggering the activation of signaling pathways, preventing apoptosis of cancer cells. We investigated the effect of the mutation L265P in the signaling properties and TIR domains. We have discovered that the mere mutated MyD88 TIR domain triggers activation, which is dependent on the presence of the endogenous MyD88, which suggests that there may be an increase in the activation of the cells, with only one mutated allele. In addition to the most common mutations described in the literature, we prepared additional artificial mutations in the vicinity of mutations associated with lymphoma, and having similar chemical properties. Results showed selection of mutations during the development of cancer that exert the strongest activation, and thus the survival of cancer cells, where the natural lymphoma mutants were most active. The publication showed that the cancer cells are killed by the addition of the peptide, which prevented the dimerization of MyD88. The research involved productive combination of molecular and cellular immunology and molecular dynamics simulations. 3.Poročilo o realizaciji predloženega programa dela na raziskovalnem projektu2 V projektu smo izvedli raziskave molekulskega mehanizma signalizacije preko signalnega adapterja MyD88. MyD88 je ključni adapter za signalizacijo Tollu podobnih receptorjev in IL-1 ter IL-18 signalne poti in je potreben za signalizacijo vseh TLR razen TLR3. MyD88 integrira odziv vseh TLR, zato je zelo pomemben v naravnem imunskem odzivu. V okviru projekta smo pojasnili vlogo vmesne (intermediarne, INT) domene signalnega adapterja MyD88, kot smo si zastavili v načrtu projekta. Ta proteinski adapter posreduje aktivacijo vseh TLR receptorjev razen TLR3. Njegova odsotnost povzroči izjemno občutljivost na infekcije. Doslej je bilo znano, da imata TIR ter DD domena vlogo pri interakciji s TIR domenami TLR oziroma z DD domenami IRAK kinaz. Med obema domenama se nahaja pr. 40 AK dolga vmesna domena, katere odsotnost v alternativnem transkriptu MyD88S inaktivira MyD88. Pokazali smo, da se omenjen peptid veže na IRAK4 kinazo ter da vnos tega peptida v sesalske celice inhibira aktivacijo MyD88 odvisne signalne poti TLR, pri katerih je kot adapter potreben MyD88 (t.j. TLR4, TLR2, TLR9, TLR5) ter IL1R, ne pa TNFR. Identificirali smo N-končnih 9 AK kot najbolj pomembnih za interakcijo. Pokazali smo vnos omenjenega peptida v celico, ki smo ga dosegli z dodatkom peptida, ki omogoča penetracijo celične membrane ali acilne skupine. To je prvi primer, da smo z dodatkom acilne skupne uspeli v celice vnesti inhibitor signalne poti. V živalskem modelu endotoksemije smo pokazalo pomembno zmanjšanje produkcije proinflamatornih citokinov in zmanjšanje smrtnosti, kar kaže na potencialno možnost uporabe v terapiji. Članek smo objavili v ugledni reviji na področju imunologije Journal of Immunology. TIR (Toll/IL-1 receptor) domene posredujejo interakcijo med membranskimi Tollu-podobnimi receptorji ali IL-1R in signalnimi adapterji, ki vsebujejo TIR domene (MyD88, TRIF, TRAM, Mal). V naši hipotezi smo predpostavili, da se dimerna TIR domena močneje veže na dimeren TLR kot monomer, ki je sicer inhibitoren. Predvidevali smo, da v odsotnosti domene smrti dimerna TIR domena močneje inhibira signalizacijo. To smo dejansko tudi opazili vendar je bilo presenečenje, da je dimer ob višjem izražanju pokazal konstitutivno aktivacijo, za kar je bila potrebna prisotnost adapterja MyD88. To nakazuje, da dimerna TRI domena MyD88 inducira tvorbo oligomerov MyD88, ki so konstitutivno aktivni. Dimerizacija preko obvite vijačnice je povzročila močnejšo inhibicijo in skoraj nobene konstitutivne aktivacije. Pokazali smo, da dodatek dimerizacijske domene z obvito vijačnico pomembno izboljša inhibicijo aktivacije TLR ter IL1R. Proteine s TIR domenami izražajo tudi številne patogene bakterije, za katere so že poročali, da povzročijo imunosupresijo TLR signalne poti, kar so pripisovali bazično domeni, ki je podobna adapterju Mal. Ugotovili smo, da je boljša inhibicija ter odsotnost konstitutivne aktivnosti dimerne oblike TIR domene, posredovane z dimerizacijo preko obvite vijačnice vzrok za prisotnost takšne domene v TCP patogenih bakterij. Konkretno smo raziskali N-končno domeno proteina TcpB Brucelle abortus, za katero so že prej pokazali, da ima vlogo kot pomemben virulenčni dejavnik. Dodatek obvite vijačnice TcpB k TIR domeni MyD88 je povzročil izboljšanje inhibicije. Dodatek domene z obvito vijačnico je izboljšal inhibicijo širokega spektra TLRs in prepreči konstitutivno aktivacijo, pri čemer smo opazili doslej najboljšo inhibicijo TLR če smo uporabili obvito vijačnico, ki tvori zelo stabilen dimer. Ta tip proteina ima zato potencialno uporabo v terapiji, zato smo tudi vložili patentno prijavo. Na osnovi teh rezultatov smo predlagali molekularni model z MyD88 posredovanega signaliziranja, ki temelji na dimerizacijo domen TIR. Nekateri mikroorganizmi izražajo proteine, ki vsebujejo TIR-domene, katerih funkcija je imunosupresija signalizacije TLR. V naših raziskavah smo odkrili vlogo dimerizacije TIR^ domene tako za inhibicijo, kot tudi za aktiviranje MyD88 signalne poti. Številni bakterijski proteini s TIR domeno (TCP) vsebujejo tudi domeno obvite vijačnice za dimerizacijo. Pokazali smo, da dodatek dimerizacijske domene z obvito vijačnico pomembno izboljša inhibicijo aktivacije TLR ter IL1R, kar je vzrok za prisotnost takšne domene v TCP patogenih bakterij. Konkretno smo raziskali N-končno domeno proteina TcpB Brucelle abortus, za katero so že prej pokazali, da ima vlogo kot pomemben virulenčni dejavnik. Mutacije v MyD88 so povezane z limfomom, predvsem Leu 265 Pro (L265P) mutacija, ki se nahaja v TIR domeni. Ta in druge sorodne mutacije v TIR domeni MyD88 omogoči preživetje rakastih celic zaradi konstitutivne aktivacije NF-KB signalizacije. Ugotovili smo, da L265P in druge mutacije v TIR domeni, v nasprotju z dominantno negativno aktivnostjo domene divjega tipa TIR, sprožijo aktivacijo celic odvisno od endogenega MyD88. Mutirana TIR domena je imela povečano oligomerizacijo in vitro in je povzročila tvorbo citosolnih agregatov v celicah v katere smo jo vnesli. V teh celicah smo pokazali kolokalizacijo mutirane TIR domene z MyD88 ter IRAKI, ne pa s TIR domeno divjega tipa. Enak efekt agregacije smo opazili tudi pri celičnih linijah človeškega limfoma. Simulacija molekulske dinamike kaže, da mutacije povezane z limfomom ne povzročijo večje konformacijske spremembe v strukturi TIR domene ampak imajo alosterično delovanja preko spremembe mobilnosti aminokislin, ki povečajo težnjo po dimerizaciji. V nasprotju s predpostavko projekta se je izkazalo, da mutacija v TIR domeni ne poruši zvitja domene ampak povzroči njeno reorganizacijo, ki alosterično spremeni njeno afiniteto do asociacije z drugo domeno TIR. To smo dokazali s pripravo več mutacij znotraj domene TIR, kjer se je izkazalo, da velika večina umetnih mutacij ne povzroči konstitutivne aktivacije, čeprav smo izbrali mutacije na navidezno ekvivalentnih mestih kot tiste identificirane v limfomu, prav tako pa smo uvedli podoben tip mutacij. Ti rezultati kažejo, da so mutacije opažene v limfomu selekcionirane preko selekcijskega pritiska, ker le ustrezne mutacije zagotovijo signal za preživetje. Omenjene raziskave smo opravljali v sodelovanju s skupino prof. Alexandra Webra v Tuebingenu ter prof. Janeza Mavrija na Kemijskem inštitutu. Analizirali smo vpliv 4 mutant v TIR domeni MyD88, ki so bile najdene pri pacientih z B-celičnim limfomom. V reporterskih HEK293 celicah smo pokazali konstitutivno aktivacijo NFkappaB signalne poti v mutantah, v največji meri prav v mutanti L265P. Pripravili smo tudi set umetnih mutant v TIR domeni človeškega MyD88 na mestih v bližini onkogenih mutacij ter s podobno spremembo lastnosti aminokislin. Za razliko od onkogenih mutant so umetne mutante pokazale zelo malo konstitutivne aktivnosti, kar kaže, da so mutacije, ki se pojavljajo pri limfomu izbrane preko selekcijskega pritiska, ker omogočijo preživetje rakasto spremenjenih celic. Pripravili smo peptid na osnovi TIR domene MyD88 iz segmenta, ki je udeležen v dimerizaciji ter segmenta, ki omogoči vnos peptida v celico. Izkazalo se je, da peptid povzroči smrt rakavih celic o omenjeno mutacijo MyD88. MyD88 se ob aktivaciji združuje v velike skupke, imenovane Myddosom. Kristalna struktura dela Myddosoma iz DD MyD88, IRAK4 ter IRAK2 je pokazala tvorbo kompleksa sestavljenega iz 14 domen, od tega 6 DD domen MyD88. DD se nahaja na N-koncu MyD88, čeprav protein vsebuje tudi krajši N-terminalni segment, ki ni strukturiran. Ob prijavi projekta smo postavili hipotezo, da ta del MyD88 Na področju raziskav povezave fosfatidične kisline in MyD88 smo dobili rezultate, ki potrjujejo to povezavo. Pripravili smo več mutant N-terminalnega konca MyD88. Skrajšanje N-konca MyD88 je povzročilo izgubo funkcionalnosti MyD88, ki je lepo korelirala z njeno difuzno lokalizacijo v primerjavi z akvtivnimi variantami, ki so tvorile gruče. Medtem ko se divji tip MyD88 v celicah združuje v skupke pa je odstranitev N-konca povzročila difuzno lokalizacijo proteina. To kaže, da je ta segment bistven za asociacijo MyD88 na delu, ki je odgovoren za vezavo fosfatidične kisline. Doseženi rezultati so pomembno prispevali k razumevanju delovanja naravnega imunskega sistema. 4.Ocena stopnje realizacije programa dela na raziskovalnem projektu in zastavljenih raziskovalnih ciljev3 Delo na projektu je potekalo v skladu z predlogom projekta. V celoti smo izvedli vse cilje predlaganega projekta: točka 1 (vloga INT domene pri signalizaciji preko MyD88) , točka 2 (vloga fsfatidične kilsine pri signalizaciji MyD88) točka 3 (mehanizem konstitutivne aktivacije MyD88 preko mutacij povezanih z limfomom) točka 4 (vloga dimerizacije TIR domen za imunosupresijo bakterijskih TCP). Vse rezultate razen dela na vplivu fosfatidične kisline smo že objavili, medtem ko bodo rezultati o vplivu fosfatidične isline poslani v objavo v letu 2015. 5.Utemeljitev morebitnih sprememb programa raziskovalnega projekta oziroma sprememb, povečanja ali zmanjšanja sestave projektne skupine4 Ni bilo sprememb razen manjših sprememb v sestavi rpojektne skupine zaradi menjave služb in pododniške odsotnosti. 6.Najpomembnejši znanstveni rezultati projektne skupine5 Znanstveni dosežek 1. COBISS ID 5607194 Vir: COBISS.SI Naslov SLO Aktivacija mutant MyD88 povezabnega z limfomom preko alosterične oligomerizacije domene TIR ANG Activation of lymphoma-associated MyD88 mutations via allostery-induced TIR domain oligomerization Opis SLO MyD88, združuje signale več celičnih receptorjev TLR. Raziskovalci so odkrili, da omenjena mutacija povzroča, da se mutirani proteini povezujejo med seboj, s čimer sprožijo aktivacijo signalnih poti, kar prepreči propad rakastih celic. Raziskava je pokazala, da so med razvojem B-celičnega limfoma izbrane prav tiste mutacije, ki omogočijo najmočnejšo aktivacijo in s tem preživetje rakastih celic. Za aktivacijo zadošča mutacija v samo eni od dveh kopij gena, ker se mutirana oblika MyD88 veže tudi na normalno obliko proteina n sproži aktivacijo. V publikaciji so pokazali, da lahko rakave celice ubijejo z dodatkom peptida, ki prepreči dimerizacijo MyD88. Raziskava temelji na kombinaciji pristopov molekularne in celične imunologije z molekulskimi simulacijami ANG Myeloid differentiation 88 (MyD88) is the key signaling adapter of Toll-like and interleukin-1 receptors. Recurrent lymphoma-associated mutations, particularly Leu265Pro (L265P), within the MyD88 Toll/interleukin-1 receptor (TIR) domain sustain lymphoma cell survival due to constitutive nuclear factor kB signaling. We found that mutated TIR domains displayed an intrinsic propensity for augmented oligomerization and spontaneous formation of cytosolic Myddosome aggregates in lymphoma cell lines, mimicking the effect of dimerized TIR domains. Blocking of MyD88 oligomerization induced apoptosis. The L265P TIR domain can recruit the endogenous wild-type MyD88 for oligomer formation and hyperactivity. Molecular dynamics simulations and analysis of additional mutations suggest that constitutive activity is caused by allosteric oligomerization. Objavljeno v Grune and Stratton.; Blood; 2014; Vol. 124, iss. 26; str. 3896-3904; Impact Factor: 9.775;Srednja vrednost revije / Medium Category Impact Factor: 3.037; A'': 1;A': 1; WoS: MA; Avtorji / Authors: Avbelj Monika, Wolz Olaf-Oliver, Fekonja Ota, Benčina Mojca, Repič Matej, Mavri Janez, Krüger Jens, Schärfe Charlotta, Delmiro-Garcia Magno, Panter Gabriela, Kohlbacher Oliver, Weber Alexander N. R., Jerala Roman Tipologija 1.01 Izvirni znanstveni članek 2. COBISS ID 2910088 Vir: COBISS.SI Naslov SLO Vloga vmesne INT domene MyD88 za aktivacijo in terapevtsko inhibicijo TLR ANG The role of intermediary domain of MyD88 in cell activation and therapeutic inhibition of TLRs Opis SLO Adapter MyD88 ima ključno vlogo pri signalizaciji TLR in IL-1R. MyD88 je sestavljen iz smrti domene in Toll/IL-1R domene, kateri povezuje vmesna domena (INT). Peptid na osnovi INT domene zavira aktivacijo TLR4 z LPS, če peptid vnesemo v celice. Ugotovili smo, da je tarča peptida INT IL-1R-povezana kinaze 4 (IRAK4). Poleg TLR4, INT peptid zavira tudi TLR5, ki TLR2, ki TLR9 in IL-1R signalizacija, ne pa TLR3, ki uporablja TRIF adapter. V živalskem modelu sepse, je INT peptid inhibiral proizvodnjo vnetnih citokinov in izboljšal preživetje, kar podpira terapevtsko uporabo INT peptidov za inhibicijo vnetij posredovanih preko MyD88. Adaptor MyD88 has a pivotal role in TLR and IL-1R signaling and is involved in mediating excessive inflammation. MyD88 is composed of a death domain and a Toll/IL-1R domain connected by an intermediary domain (INT). The alternatively spliced form of MyD88 lacking the INT prevents signaling through MyD88-dependent TLRs. We designed a peptide from the ANG INT and showed that it inhibits TLR4 activation by LPS when linked to a cell-penetrating peptide. As a new approach for the delivery of signaling-inhibitory peptides, INT peptide acylation also provided efficient cell translocation and inhibition of activation. We determined that INT peptide targets IL-1R-associated kinase 4. Furthermore, MyD88 mutant and molecular modeling refines the MyD88- IL-1R-associated kinase 4 interaction model based on the Myddosome structure. In addition to TLR4, INT peptide also inhibited TLR5, TLR2, TLR9, and IL-1R signaling but not TLR3, which uses Toll/IL-1R domain-containing adapter inducing IFN-ß signaling adaptor. Inhibition of signaling in murine and human cells was observed by decreased NF-kB activation, cytokine mRNA synthesis, and phosphorylation of downstream kinases. In the endotoxemic mouse model, INT peptide suppressed production of inflammatory cytokines and improved survival, supporting therapeutic application of INT peptides for the suppression of inflammatory conditions mediated by MyD88. Objavljeno v Williams & Wilkins; The journal of immunology; 2011; Vol. 187, no. 5; str. 2394-2404; Impact Factor: 5.788;Srednja vrednost revije / Medium Category Impact Factor: 4.167; A': 1; WoS: NI; Avtorji / Authors: Avbelj Monika, Horvat Simon, Jerala Roman Tipologija 1.01 Izvirni znanstveni članek 3. COBISS ID 4652570 Vir: COBISS.SI Naslov SLO Ektodomena receptorja TLR4 prepreči konstitutivno aktivacijo ANG Ectodomain of the toll-like receptor 4 prevents constitutive receptor activation Opis SLO Tollu podobni receptor 4 (TLR4) je vključen v aktivacijo prirojenega imunskega odziva pri velikem številu različnih bolezni. Kljub številnim študijam je vloga posameznih področij TLR4 v regulacijo aktivacije receptorja slabo poznana. Zamenjava TLR4 ektodomene z LPS-vezavnih proteinov MD-2 ali CD14 povzročilo močno konstitutivno aktivacijo, primerljivo z maksimalno stimulacijo receptorja z LPS. Enak učinek je bil dosežen z zamenjavo ektodomene z monomernim fluorescentnim proteinom ali s fragmentom 24 kDa giraze B. Tako smo pokazali nagnjenost do dimerizacije transmembranske in citoplazemske domene TLR4 in odkrili prej neznano funkcijo ektodomene na inhibicijo spontane dimerizacije receptorja. Konstitutivna aktivacija je bila izginila z zamenjavo ektodomene z ovalbuminom. Odstranitev N-terminalnih variante TLR4 je pokazala, da najmanjši segment ektodomene ki že preprečuje konstitutivno aktivnost obsega samo 90 ostankov (542-631) od skupno 608. Sklepamo, da je TLR4 receptor z nizkim pragom aktivacije, ki se lahko hitro sproži sproščanje inhibicije preko ektodomene. To je pomembno za občutljivost TLR4 aktivacije z različnimi agonisti. ANG Toll-like receptor 4 (TLR4) is involved in activation of innate immune response in a large number of different diseases. Despite numerous studies, the role of separate domains of TLR4 in the regulation of receptor activation is poorly understood. Replacement of the TLR4 ectodomain with LPS-binding proteins MD-2 or CD14 resulted in a robust ligand-independent constitutive activation, comparable to the maximal stimulation of the receptor with LPS. The same effect was achieved by the replacement of the ectodomain with a monomeric fluorescent protein or a 24 kDa gyrase B fragment. This demonstratesan intrinsic dimerization propensity of the transmembrane and cytoplasmic domains of TLR4 and reveals a previously unknown function of the ectodomain in inhibiting spontaneous receptor dimerization. Constitutive activation was abolished by the replacement of ectodomain by a bulkier proteinovalbumin. N-terminal deletion variants of TLR4 revealed that the smallest segment of the ectodomain that already prevents constitutive activitycomprises only 90 residues (542 to 631) out of the total 608 residues.We conclude that TLR4 represents a receptor with low threshold of activation, which can be rapidly activated by the release of inhibition exerted by its ectodomain. This is important for the sensitivity of TLR4 to activation by different agonists. TLR4 ectodomain has multiple roles in enabling ligand regulated activation, providing proper localization, while serving as an inhibitor to prevent spontaneous, ligand-independent dimerization. Objavljeno v American Society of Biological Chemists.; The Journal of biological chemistry; 2011; Vol. 286, no. 26; str. 23334-23344; Impact Factor: 4.773;Srednja vrednost revije / Medium Category Impact Factor: 3.739; A': 1; WoS: CQ; Avtorji / Authors: Panter Gabriela, Jerala Roman Tipologija 1.01 Izvirni znanstveni članek 4. COBISS ID 5026586 Vir: COBISS.SI Naslov SLO TR domena kot platforma za aktivacijo in inhibicijo signalizacije TLR ANG Toll/interleukin-1 receptor domain dimers as the platform for activation and enhanced inhibition of Toll-like receptor signaling Opis SLO TIR domena posreduje interakcije med TLR (Toll-like) in IL-1 družine receptorjev in signalnih adapterjev. Medtem ko homotipske interakcije TIR domen posredujejo aktivacijo receptorja jih uporabljajo tudi mikrobi, ki vsebujejo proteine s TIR-domenami za imunosupresijo.V tem delu smo pojasnili vlogo dimerizirane TIR domene kot platforme za inhibicijo kot tudi za aktivacijo MyD88 signalne poti. Coiled-coil dimerizacijska domena, ki je prisotna v številnih bakterijskih TCPs močno povečuje inhibicijo TLR / IL-1R signalizacije. Dodatek umetne dimerizacijske domene je inhibiral širok spekter TLR in preprečil konstitutivno aktivacijo z dimerno platformo TIR. Predlagamo molekulski model MyD88 posredovane signalizacije na osnovi dimerizacije domen TIR kot ključnega koraka signalizacije. ANG TIR (Toll/IL-1 receptor) domains mediate interactions between TLR (Tolllike) or IL-1 family receptors and signaling adapters. While homotypic TIR domain interactions mediate receptor activation they are also usurped by microbial TIR-domain containing proteins for immunosuppression. Here we show the role of a dimerized TIR domain platform for the suppression as well as for the activation of MyD88 signaling pathway. Coiled-coil dimerization domain, present in many bacterial TCPs, potently augments suppression of TLR/IL-1R signaling. The addition of a strong coiled-coil dimerization domain conferred the superior inhibition against the wide spectrum of TLRs and prevented the constitutive activation by a dimeric TIR platform. We propose a molecular model of MyD88-mediated signaling based on the dimerization of TIR domains as the limiting step. Objavljeno v American Society of Biological Chemists.; The Journal of biological chemistry; 2012; Vol. 287, no. 37; str. 30993-31002; Impact Factor: 4.651;Srednja vrednost revije / Medium Category Impact Factor: 3.761; A': 1; WoS: CQ; Avtorji / Authors: Fekonja Ota, Benčina Mojca, Jerala Roman Tipologija 1.01 Izvirni znanstveni članek 7.Najpomembnejši družbeno-ekonomski rezultati projektne skupine6 Družbeno-ekonomski dosežek 1. COBISS ID 36962309 Vir: COBISS.SI Naslov SLO Povezava med TIR domenami je osnova imunosupresije v bakterisjkih infekcijah in aktivaciji MyD88 v B-celičnem limfomu ANG Association of TIR domains underlying immunosuppression in bacterial infection and activation of MyD88 mediated cell signaling associated with B-cell lymphoma Opis SLO Vabljeno predavanje na 15.svetovnem kongresu imunologije v Milanu, avgista 2013, kjer so se predstavili vsi vodilni imunologi. ANG Invited lecture at 15th International Congress on Immunology (ICI), 22 -27 August 2013, Milano, Italy Šifra B.04 Vabljeno predavanje Objavljeno v 2013; Avtorji / Authors: Fekonja Ota, Avbelj Monika, Jerala Roman Tipologija 3.15 Prispevek na konferenci brez natisa 2. COBISS ID 36959493 Vir: COBISS.SI Naslov SLO Molekulski mehanizem aktivacije TLR4 z endogenimi agonisti in različnimi kemotipi LPS ANG Molecular mechanism of TLR4 activation by endogenous agonists and different chemotypes of LPS Opis SLO Vabljeno predavanje na satelitskem kongresu 15.ICI v Mlanu: TLR4 signaling and beyond ANG Sattelite meeting SM7 of 15th ICI: Endotoxin, TLR4 signaling and beyond; Milano, Italy, 21 August 2013. Milano, 2013 Šifra B.03 Referat na mednarodni znanstveni konferenci Objavljeno v 2013; Avtorji / Authors: Jerala Roman Tipologija 3.15 Prispevek na konferenci brez natisa 3. COBISS ID 4905754 Vir: COBISS.SI Naslov SLO Molekulski mehanizem aktivacije in inhibicije TLR4 in MyD88 signalizacije ANG Molecular mechanism of activation and inhibition inTLR4 and MyD88 mediated signaling Opis SLO Vabljeno predavanje na Univerzi v Tokiu, Inštitut za medicinske znanosti, avgust 2011 ANG Lecture at the Institute of Medical Science, University of Tokyo, Tokyo, Japan, August 23, 2011. Tokyo Šifra B.04 Vabljeno predavanje Objavljeno v [S.n.]; 2011; Avtorji / Authors: Jerala Roman Tipologija 3.14 Predavanje na tuji univerzi 4. COBISS ID 259787520 Vir: COBISS.SI Naslov SLO Vloga domen adapterskega proteina MYD88 pri aktivaciji prirojene imunosti ANG Role of diferent domains of an adapter protein MyD88 in activation of innate immunity Opis SLO Mentorstvo doktorskega dela Monike Avbelj, v katerem je izvedla raziskave signalizacije MyD88 in vlogo INT domene. ANG Mentorship of the PhD of Minika Avbelj Šifra D.09 Mentorstvo doktorandom Objavljeno v M. Avbelj; 2011; XIV, 79, 11 f.; Avtorji / Authors: Avbelj Monika Tipologija 2.08 Doktorska disertacija 5. COBISS ID 4905498 Vir: COBISS.SI Naslov SLO Molekularni mehanizem aktivacije in inhibicije inTLR4 in MyD88 posredovane signalizacijo ANG Molecular mechanism of activation and inhibition inTLR4 and MyD88 mediated signaling Opis SLO V vabljenem predavanju na Univerzi v Osaki sem predstavil rezultate programske skupine na področju raziskav naravne imunosti. To je najbolj uspešna skupina s področja raziskav imunologije na svetu. ANG In the invited lecture at the University of Osaka, I presented the results of the program group in the field of innate immunity. This is the most successful group in the field of immunology research worldwide. Šifra B.04 Vabljeno predavanje Objavljeno v [S.n.]; 2011; Avtorji / Authors: Jerala Roman Tipologija 3.14 Predavanje na tuji univerzi 8.Drugi pomembni rezultati projetne skupine7 9.Pomen raziskovalnih rezultatov projektne skupine8 9.1.Pomen za razvoj znanosti9 SLO_ V okviru projekta smo naredili pomembne korake v razumevanju molekulskega mehanizma signalizacije preko adapterskega proteina MyD88, ki je osrednji posrednik signalizacije TLR ter IL1R. Identificirali smo novo, doslej še neznano vlogo posameznih poddomen proteina MyD88, tako vmesne INT domene kot tudi N-terminalnega konca proteina pred DD. Ugotovili smo, da je dimerizacija TIR domen ključni korak ob aktivaciji pri čemer lahko umetna dimerizacija sproži aktivacijo ali povzroči boljšo inhibicijo, kar je zanimivo za razvoj novih terapevtskih strategij. Pojasnili smo molekulski mehanizem aktivacije mutant v TIR domeni MyD88, ki so povezane z velikoceličnim B-limfomov ter fizioloških posledic, ki izvirajo iz teh rezultatov. ANG_ Within the project we made significant advances towards understanding the molecular mechanism of signaling through the adapter protein MyD88, which is a central mediator of TLR signaling and IL1R. We have identified a new, so far unknown role of specific sub-domains of the protein MyD88, such as intermediate INT domain and the N-terminal end of the protein prior to DD. We found that the dimerization of the TIR domain is a key step in the activation of which enables the dimerization to trigger activation or coupled by coiled-coil induced dimerization to cause greater inhibition, which is interesting for the development of new therapeutic strategies. We explained the molecular mechanism of activation of the mutants in the TIR domain of MyD88, which are associated with B-cell lymphoma, and physiological effects, resulting from these results. 9.2. Pomen za razvoj Slovenije10 SLO_ Rezultati projekta so pomembni za Slovenijo, ker so rezultati relevantni za zdravje, saj je naravna imunost pomembna tako za infekcije kot za druge vnetne bolezni in rak. Raziskave na tem področju omogočajo stik s svetovnim vrhom na področju imunologije, ki je pomembna za zdravje. Pomembna je vloga članov skupine za šolanje usposobljenih raziskovalcev, ki so sposobni reševati zahtevne znanstvene ter razvojne probleme. Uspehi na tem področju znanosti ter intenzivna mednarodna vpetost pomenijo promocijo Slovenije kot znanstveno razvite države ter za promocijo znanosti kot ključnega dejavnika uspešnega razvoja Slovenije. ANG The results of the project are important for Slovenia, since the results are relevant to the health, since the innate immunity is important for infectious diseases as well as for other inflammatory diseases and cancer. Research in this area allows the contact with the world class research in the field of immunology, which is particularly important for health. The important role of the group members for training qualified researchers who are able to solve complex scientific and developmental problems. Success in this field of science and intense international involvement the promotion of Slovenia as the scientifically developed country and for the promotion of science as a key factor in the successful development of Slovenia. 10.Samo za aplikativne projekte in podoktorske projekte iz gospodarstva! Označite, katerega od navedenih ciljev ste si zastavili pri projektu, katere konkretne rezultate ste dosegli in v kakšni meri so doseženi rezultati uporabljeni Cilj F.01 Pridobitev novih praktičnih znanj, informacij in veščin Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 - Uporaba rezultatov 1 - F.02 Pridobitev novih znanstvenih spoznanj Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 - F.03 Večja usposobljenost raziskovalno-razvojnega osebja Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 - F.04 Dvig tehnološke ravni Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 - Uporaba rezultatov 1 - F.05 Sposobnost za začetek novega tehnološkega razvoja Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 - Uporaba rezultatov 1 - F.06 Razvoj novega izdelka Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 - Uporaba rezultatov 1 - F.07 Izboljšanje obstoječega izdelka Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 - F.08 Razvoj in izdelava prototipa Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 - Uporaba rezultatov 1 v F.09 Razvoj novega tehnološkega procesa oz. tehnologije Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 v F.10 Izboljšanje obstoječega tehnološkega procesa oz. tehnologije Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 v F.11 Razvoj nove storitve Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 - Uporaba rezultatov 1 v F.12 Izboljšanje obstoječe storitve Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 v F.13 Razvoj novih proizvodnih metod in instrumentov oz. proizvodnih procesov Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 v F 14 Izboljšanje obstoječih proizvodnih metod in instrumentov oz. proizvodnih procesov Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 v F.15 Razvoj novega informacijskega sistema/podatkovnih baz Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 v F.16 Izboljšanje obstoječega informacijskega sistema/podatkovnih baz Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 v F.17 Prenos obstoječih tehnologij, znanj, metod in postopkov v prakso Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 - Uporaba rezultatov 1 v F is Posredovanje novih znanj neposrednim uporabnikom (seminarji, forumi, konference) Zastavljen cilj DA NE Rezultat I - Uporaba rezultatov I - F.19 Znanje, ki vodi k ustanovitvi novega podjetja ("spin off") Zastavljen cilj DA NE Rezultat I v Uporaba rezultatov I - F.20 Ustanovitev novega podjetja ("spin off") Zastavljen cilj DA NE Rezultat I - Uporaba rezultatov I - F.21 Razvoj novih zdravstvenih/diagnostičnih metod/postopkov Zastavljen cilj DA NE Rezultat I v Uporaba rezultatov I - F.22 Izboljšanje obstoječih zdravstvenih/diagnostičnih metod/postopkov Zastavljen cilj DA NE Rezultat I - Uporaba rezultatov I - F.23 Razvoj novih sistemskih, normativnih, programskih in metodoloških rešitev Zastavljen cilj DA NE Rezultat I v Uporaba rezultatov I - F 24 Izboljšanje obstoječih sistemskih, normativnih, programskih in metodoloških rešitev Zastavljen cilj DA NE Rezultat I - Uporaba rezultatov I - F.25 Razvoj novih organizacijskih in upravljavskih rešitev Zastavljen cilj DA NE Rezultat I v Uporaba rezultatov I - F.26 Izboljšanje obstoječih organizacijskih in upravljavskih rešitev Zastavljen cilj DA NE Rezultat I v Uporaba rezultatov I - F.27 Prispevek k ohranjanju/varovanje naravne in kulturne dediščine I Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 - F.28 Priprava/organizacija razstave Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 - Uporaba rezultatov 1 - F.29 Prispevek k razvoju nacionalne kulturne identitete Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 - Uporaba rezultatov 1 - F.30 Strokovna ocena stanja Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 - F.31 Razvoj standardov Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 - Uporaba rezultatov 1 - F.32 Mednarodni patent Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 - Uporaba rezultatov 1 - F.33 Patent v Sloveniji Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 - Uporaba rezultatov 1 - F.34 Svetovalna dejavnost Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 - F.35 Drugo Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 v Uporaba rezultatov 1 - Komentar ll.Samo za aplikativne projekte in podoktorske projekte iz gospodarstva! Označite potencialne vplive oziroma učinke vaših rezultatov na navedena področja Vpliv Ni vpliva Majhen vpliv Srednji vpliv Velik vpliv G.01 Razvoj visokošolskega izobraževanja G.01.01. Razvoj dodiplomskega izobraževanja O o o o G.01.02. Razvoj podiplomskega izobraževanja o o o o G.01.03. Drugo: o o o o G.02 Gospodarski razvoj G.02.01 Razširitev ponudbe novih izdelkov/storitev na trgu O O O O G.02.02. Širitev obstoječih trgov o o o o G.02.03. Znižanje stroškov proizvodnje o o o o G.02.04. Zmanjšanje porabe materialov in energije O O O O G.02.05. Razširitev področja dejavnosti o o o o G.02.06. Večja konkurenčna sposobnost o o o o G.02.07. Večji delež izvoza o o o o G.02.08. Povečanje dobička o o o o G.02.09. Nova delovna mesta o o o o G.02.10. Dvig izobrazbene strukture zaposlenih O O O O G.02.11. Nov investicijski zagon o o o o G.02.12. Drugo: o o o o G.03 Tehnološki razvoj G.03.01. Tehnološka razširitev/posodobitev dejavnosti O O O O G.03.02. Tehnološko prestrukturiranje dejavnosti O O O O G.03.03. Uvajanje novih tehnologij o o o o G.03.04. Drugo: o o o o G.04 Družbeni razvoj G.04.01 Dvig kvalitete življenja o o o o G.04.02. Izboljšanje vodenja in upravljanja o o o o G.04.03. Izboljšanje delovanja administracije in javne uprave O O O O G.04.04. Razvoj socialnih dejavnosti o o o o G.04.05. Razvoj civilne družbe o o o o G.04.06. Drugo: o o o o G.05. Ohranjanje in razvoj nacionalne naravne in kulturne dediščine in identitete O O O O G.06. Varovanje okolja in trajnostni razvoj O O O O G.07 Razvoj družbene infrastrukture Informacijsko-komunikacijska G.07.01. infrastruktura O o o o G.07.02. Prometna infrastruktura o o o o G.07.03. Energetska infrastruktura o o o o G.07.04. Drugo: o o o o G.08. Varovanje zdravja in razvoj zdravstvenega varstva O O O O G.09. Drugo: o o o o Komentar 12.Pomen raziskovanja za sofinancerje11 Sofinancer 1. Naziv Naslov Vrednost sofinanciranja za celotno obdobje trajanja projekta je znašala: EUR Odstotek od utemeljenih stroškov projekta: % Najpomembnejši rezultati raziskovanja za sofinancerja Šifra 1. 2. 3. 4. 5. Komentar Ocena 13.Izjemni dosežek v letu 201412 13.1. Izjemni znanstveni dosežek Pred štirimi leti so raziskovalci iz ZDA ugotovili, da je pri določenih vrstah limfoma, raka belih krvničk, zelo pogosta mutacija proteina MyD88, ki v celicah posreduje informacijo o bakterijskih in virusnih infekcijah. MyD88, združuje signale več celičnih receptorjev TLR. Raziskovalci so odkrili, da omenjena mutacija povzroča, da se mutirani proteini povezujejo med seboj, s čimer sprožijo aktivacijo signalnih poti, kar prepreči propad rakastih celic. Raziskava je pokazala, da so med razvojem raka izbrane prav tiste mutacije, ki omogočijo najmočnejšo aktivacijo in s tem preživetje rakastih celic. Za aktivacijo zadošča mutacija v samo eni od dveh kopij gena, ker se mutirana oblika MyD88 veže tudi na normalno obliko proteina n sproži aktivacijo. V publikaciji so pokazali, da lahko rakave celice ubijejo z dodatkom peptida, ki prepreči dimerizacijo MyD88. Raziskava temelji na kombinaciji pristopov molekularne in celične imunologije z molekulskimi simulacijami. 13.2. Izjemni družbeno-ekonomski dosežek O rezultatih našega dela smo v letu 2014 poročali na več znanstvenih konferencah, od Japonske do ZDA, pa tudi v širši javnosti, preko sporočila za tiska, ki so ga povzeli številni mediji, od spletnih poročil do tiska. O najpomembnejšem rezultatu je bil pripravljen prispevek v reviji Medicina danes. C. IZJAVE Podpisani izjavljam/o, da: • so vsi podatki, ki jih navajamo v poročilu, resnični in točni • se strinjamo z obdelavo podatkov v skladu z zakonodajo o varstvu osebnih podatkov za potrebe ocenjevanja ter obdelavo teh podatkov za evidence ARRS • so vsi podatki v obrazcu v elektronski obliki identični podatkom v obrazcu v pisni obliki • so z vsebino zaključnega poročila seznanjeni in se strinjajo vsi soizvajalci projekta Podpisi: zastopnik oz. pooblaščena oseba i vodja raziskovalnega projekta: raziskovalne organizacije: Kemijski inštitut Roman Jerala ZIG Kraj in datum: Ljubljana |i0.3.2015 Oznaka poročila: ARRS-RPROJ-ZP-2015/114 1 Napišite povzetek raziskovalnega projekta (največ 3.000 znakov v slovenskem in angleškem jeziku) Nazaj 2 Napišite kratko vsebinsko poročilo, kjer boste predstavili raziskovalno hipotezo in opis raziskovanja. Navedite ključne ugotovitve, znanstvena spoznanja, rezultate in učinke raziskovalnega projekta in njihovo uporabo ter sodelovanje s tujimi partnerji. Največ 12.000 znakov vključno s presledki (približno dve strani, velikost pisave 11). Nazaj 3 Realizacija raziskovalne hipoteze. Največ 3.000 znakov vključno s presledki (približno pol strani, velikost pisave 11) Nazaj 4 V primeru bistvenih odstopanj in sprememb od predvidenega programa raziskovalnega projekta, kot je bil zapisan v predlogu raziskovalnega projekta oziroma v primeru sprememb, povečanja ali zmanjšanja sestave projektne skupine v zadnjem letu izvajanja projekta, napišite obrazložitev. V primeru, da sprememb ni bilo, to navedite. Največ 6.000 znakov vključno s presledki (približno ena stran, velikost pisave 11). Nazaj 5 Navedite znanstvene dosežke, ki so nastali v okviru tega projekta. Raziskovalni dosežek iz obdobja izvajanja projekta (do oddaje zaključnega poročila) vpišete tako, da izpolnite COBISS kodo dosežka - sistem nato sam izpolni naslov objave, naziv, IF in srednjo vrednost revije, naziv FOS področja ter podatek, ali je dosežek uvrščen v A'' ali A'. Nazaj 6 Navedite družbeno-ekonomske dosežke, ki so nastali v okviru tega projekta. Družbeno-ekonomski rezultat iz obdobja izvajanja projekta (do oddaje zaključnega poročila) vpišete tako, da izpolnite COBISS kodo dosežka - sistem nato sam izpolni naslov objave, naziv, IF in srednjo vrednost revije, naziv FOS področja ter podatek, ali je dosežek uvrščen v A'' ali A'. Družbeno-ekonomski dosežek je po svoji strukturi drugačen kot znanstveni dosežek. Povzetek znanstvenega dosežka je praviloma povzetek bibliografske enote (članka, knjige), v kateri je dosežek objavljen. Povzetek družbeno-ekonomskega dosežka praviloma ni povzetek bibliografske enote, ki ta dosežek dokumentira, ker je dosežek sklop več rezultatov raziskovanja, ki je lahko dokumentiran v različnih bibliografskih enotah. COBISS ID zato ni enoznačen, izjemoma pa ga lahko tudi ni (npr. prehod mlajših sodelavcev v gospodarstvo na pomembnih raziskovalnih nalogah, ali ustanovitev podjetja kot rezultat projekta ... - v obeh primerih ni COBISS ID). Nazaj 7 Navedite rezultate raziskovalnega projekta iz obdobja izvajanja projekta (do oddaje zaključnega poročila) v primeru, da katerega od rezultatov ni mogoče navesti v točkah 6 in 7 (npr. ni voden v sistemu COBISS). Največ 2.000 znakov, vključno s presledki. Nazaj 8 Pomen raziskovalnih rezultatov za razvoj znanosti in za razvoj Slovenije bo objavljen na spletni strani: http://sicris.izum.si/ za posamezen projekt, ki je predmet poročanja Nazaj 9 Največ 4.000 znakov, vključno s presledki Nazaj 10 Največ 4.000 znakov, vključno s presledki Nazaj 11 Rubrike izpolnite / prepišite skladno z obrazcem "izjava sofinancerja" http://www.arrs.gov.si/sl/progproj/rproj/gradivo/, ki ga mora izpolniti sofinancer. Podpisan obrazec "Izjava sofinancerja" pridobi in hrani nosilna raziskovalna organizacija -izvajalka projekta. Nazaj 12 Navedite en izjemni znanstveni dosežek in/ali en izjemni družbeno-ekonomski dosežek raziskovalnega projekta v letu 2014 (največ 1000 znakov, vključno s presledki). Za dosežek pripravite diapozitiv, ki vsebuje sliko ali drugo slikovno gradivo v zvezi z izjemnim dosežkom (velikost pisave najmanj 16, približno pol strani) in opis izjemnega dosežka (velikost pisave 12, približno pol strani). Diapozitiv/-a priložite kot priponko/-i k temu poročilu. Vzorec diapozitiva je objavljen na spletni strani ARRS http://www.arrs.gov.si/sl/gradivo/, predstavitve dosežkov za pretekla leta pa so objavljena na spletni strani http://www.arrs.gov.si/sl/analize/dosez/. Nazaj Obrazec: ARRS-RPR0J-ZP/2015 v1.00a 64-5E-31-E0-F0-EF-AC-D3-7C-40-81-6A-15-1B-2F-A4-91-0F-DD-75 Priloga 1 VEDA Področje: 3.01 Mikrobiologija in imunologija Dosežek 1: Molekulski mehanizem aktivacije imunskega sistema mutacije proteina MyD88 pri limfomu Vir: Blood 2014, Avbelj in sod. Pred štirimi leti so raziskovalci iz ZDA ugotovili, da je pri določenih vrstah limfoma, raka belih krvničk, zelo pogosta mutacija proteina MyD88, ki v celicah posreduje informacijo o bakterijskih in virusnih infekcijah. MyD88, združuje signale več celičnih receptorjev TLR. Raziskovalci so odkrili, da omenjena mutacija povzroča, da se mutirani proteini povezujejo med seboj, s čimer sprožijo aktivacijo signalnih poti, kar prepreči propad rakastih celic. Raziskava je pokazala, da so med razvojem raka izbrane prav tiste mutacije, ki omogočijo najmočnejšo aktivacijo in s tem preživetje rakastih celic. Za aktivacijo zadošča mutacija v samo eni od dveh kopij gena, ker se mutirana oblika MyD88 veže tudi na normalno obliko proteina n sproži aktivacijo. V publikaciji so pokazali, da lahko rakave celice ubijejo z dodatkom peptida, ki prepreči dimerizacijo MyD88. Raziskava temelji na kombinaciji pristopov molekularne in celične imunologije z molekulskimi simulacijami.