J^S? ska CIP - Kataložni zapis o publikaciji Narodna in univerzitetna knjižnica, Ljubljana 576.3(075.8) ŠTRUS, Jasna Biologija živalske celice / Jasna Štrus, Rok Kostanjšek. -Ljubljana : Študentska založba, 2008. - (Knjižna zbirka Scripta / Študentska založba) ISBN 978-961-242-179-2 1. Kostanjšek, Rok 239637760 Knjižna zbirka Odgovorni urednik: Boštjan Resinovič scripta Izdajatelj: Študentska založba . ?£o“, jkštudentska tel: (01) 2510-332 'v dZaiOZba fax: (01)2522-618 http://www.studentskazalozba.si Za založbo: Igor Brlek Ustanovitelj Študentske založbe je Študentska organizacija Univerze v Ljubljani V IJUBIJANI Recenzenti: doc. dr. Peter Veranič doc. dr. Marjanca Starčič Erjavec doc. dr. Peter Stušek Lektorica: Milanka Trušnovec Računalniško oblikovanje: Jana Kuharič Naslovnica: Bojan Senjur Tisk: Ulčakar & JK Ljubljana, 2008 © Študentska založba, 2008. Vse pravice pridržane. Brez predhodnega pisnega dovoljenja Študentske založbe je prepovedano reproduciranje, distribuiranje, dajanje v najem, javna priobčitev, predelava ali druga uporaba tega avtorskega dela ali njegovih delov v kakršnem koli obsegu ali postopku, vključno s fotokopiranjem, tiskanjem, javnim interaktivnim dostopom ali shranitvijo v elektronski obliki. Jasna Štrus, Rok Kostanjšek BIOLOGIJA ŽIVALSKE CELICE s c ript a "rr VSEBINA Zahvala 7 Uvod 9 1. Biologija celice, znanost o življenju celice 11 1.1 Kaj je življenje? 13 1.2 Deset zapovedi za razlikovanje živega od neživega 15 1.3 Kemijska zgradba celic 20 1.4 Prve celice - protobionti 22 1.5 Prokariontska in evkariontska celica 23 1.6 Živalska celica kot enocelični organizem ali gradbena enota večceličarjev 27 2. Biološka membrana in transport snovi 30 2.1 Zgradba plazmaleme in endomembran 31 2.2 Transport skozi membrano 33 2.3 Diferenciacije celične membrane 36 2.4 Vzdražne lastnosti membran 39 2.5 Membranski receptorji 40 3. Celični organeli in njihove funkcionalne povezave 42 3.1 Notranje celično okolje; kemijska sestava citoplazme 42 3.2 Jedro; informacijski in regulacijski center celice 45 3.3 Mitohondriji; celične elektrarne 47 3.4 Peroksisomi; center celičnih oksidacij in razstrupljanja 49 3.5 Endoplazemski retikulum; proizvodnja proteinov in lipidov, logistični in transportni center celice 50 3.6 Golgijev aparat; procesiranje in razvrščanje celičnih produktov 52 3.7 Lizosomi; prebavni centri celice 53 3.8 Endocitoza in eksocitoza; transport snovi z vezikli 55 4. Presnova in energijski procesi v celici 57 4.1 Procesi presnove, delovanje encimov in vitaminov 57 4.2 Presnova ogljikovih hidratov, maščob in beljakovin 59 4.3 Proizvodnja energije v mitohondrijih 63 4.4 Biosintetski procesi v celici 65 5. Celično ogrodje in gibljivost celic 66 5.1 Zgradba in funkcija citoskeleta 66 5.2 Intermediarni filamenti 68 5.3 Mikrotubuli 69 5.4 Mikrofilamenti 72 6. Dednost in pretok genetske informacije 76 6.1 Nukleinske kisline, geni in genom 76 6.2 Izražanje genske informacije (ekspresija genov) 81 6.3 Regulacija sinteze beljakovin 87 6.4 Replikacija, mutacije in popravljanje DNA 89 6.5 Rekombinantna DNA in genski inženiring 92 7. Razmnoževanje celic 94 7.1 Celični cikel 94 7.2 Mitoza 95 7.3 Mejoza 99 7.4 Regulacija celičnega cikla 101 7.5 Celična smrt 102 7.6. Matične celice 103 8. Celično sporočanje; komuniciranje med celicami in okoljem 105 8.1 Delovanje sporočilnih molekul 105 8.2 Vezava sporočilnih molekul na receptorje 107 8.3 Transdukcija; pretvorba informacij na membrani v znotrajcelična sporočila 108 8.4 Celični odziv in regulacija celične aktivnosti 111 Literatura 112 ZAHVALA Kot študentko prvega letnika biologije me je pred tridesetimi leti v svet živali popeljal prof. Janez Matjašič. Z zanimivimi in slikovitimi predavanji nas je vodil »iz življenja najmanjših« v svet velikanov. Po diplomi sem kot asistentka pri vajah iz splošne zoo¬ logije pridobivala znanje ob delu s študenti in pogovorih z men¬ torjem, predavateljem splošne zoologije prof. Pavlom Ličarjem. Z nazornimi, preglednimi in duhovitimi predavanji je navduševal številne generacije biologov. Ko sem pred desetimi leti prevzela predmet Splošna zoologija, sem se zavedla, da je naslediti tako dobra predavatelja zelo težavna naloga. Z dobro osnovo, vzornimi zgledi in veliko vzpodbude z vese¬ ljem nadaljujem njuno delo. Izkušnje pridobivam tudi v stiku s predavatelji v tujini. Prof. Volker Storch predava zoologijo na Univerzi v Heidelbergu v Nemčiji. Je avtor številnih priznanih učbenikov s področja splošne in sistematske zoologije. Z njim sodelujem že vrsto let. Hvaležna sem mu za številne pogovore in razprave o tem, kako se napiše učbenik. Večji del učbenika sem napisala med študijskim obiskom Zoološkega inštituta Univerze v Heidelbergu, s finančno podporo štipendije programa Socrates-Erasmus. Z uvedbo triletnega prvostopenjskega programa Biologija na Biotehniški fakultetei UL smo predmet Splošna zoologija razdelili v dva semestrska predmeta. Predmet Biologija živalske celice in histologija obsega področje biologije živalske celice in zgradbe ter delovanja tkiv živali. Poglavje biologije celice iz učbenika Splo¬ šna zoologija je tako razširjeno in predstavljeno v novem učbeni¬ ku z naslovom BIOLOGIJA ŽIVALSKE CELICE. Dodani sta sodobni poglavji iz molekulske biologije in razmnoževanja celice, ki jih je pripravil doc. Rok Kostanjšek. Posodobljena so tudi poglavja o celičnih organelih, zgradbi in delovanju membran in celičnem sporočanju. Slikovno gradivo je v pretežni meri ohranjeno iz predhodnega učbenika, dodane so avtorske mikrografije celične ultrastrukture in prirejene nekatere sheme iz temeljnih učbenikov s področja biologije celice. Jasna Štrus Avtorja se zahvaljujeva sodelavkama Nadi Žnidaršič in Mag¬ di Tušek - Žnidarič za kakovostne ultrastrukturne posnetke. So¬ delavcema Luki Malenšku z Oddelka za biologijo in Giseli Adam z Zoološkega inštituta Univerze v Heidelbergu iskrena hvala za vztrajno in učinkovito podporo pri pripravi slikovnega gradiva. Hvala recenzentom za pripombe in razprave. Hvala generaci¬ jam študentov, ki naju spremljajo od leta 1977 oziroma 1997 in usmerjajo najino zanimanje za poučevanje biologije. Hvala tudi vsem najinim za podporo in razumevanje. Ljubljana, 2008 Avtorja 7 UVOD Skripta vsebujejo zgoščeno vsebino predavanj iz biologije ži¬ valske celice in so namenjena študentom, ki začenjajo študij na različnih področjih naravoslovja, predvsem biologom, bodočim učiteljem biologije in kemije, biotehnologom, živilskim tehnolo¬ gom in biokemikom. Namen skript je kratka predstavitev zgrad¬ be in delovanja živalske celice kot samostojne biološke enote in povezav celic v njihovem socialnem okolju. Vsebina poglavij je zgoščena in je izhodišče za poglobljen študij iz dodatnih virov, predvsem iz učbenikov s področja celične biologije. Slikovno gra¬ divo je omejeno, saj je obsežno gradivo dostopno v navedenih virih in preko spletnih knjižnic. Vsebina je razdeljena na osem poglavij: - v prvem poglavju je na kratko predstavljen razvoj celične biologije in njen pomen za razumevanje osnovnih življenj¬ skih procesov in nastanka življenja, z vso pestrostjo oblik in funkcij. Predstavljeni so osnovni tipi celic, njihove podobno¬ sti in razlike; - v drugem poglavju avtorja obravnavava zgradbo celičnih membran, izmenjavo snovi med celicami in okoljem ter osnovne mehanizme celične vzdražnosti; - tretje poglavje vsebuje osnovna dejstva o zgradbi in delo¬ vanju živalske celice, vlogo jedra in celičnih organelov za normalno delovanje celice; - četrto poglavje obravnava celični metabolizem in energijske procese v celici; - v petem poglavju je predstavljen citoskelet v povezavi s ce¬ ličnim gibanjem, razporejanjem celičnih organelov in vzdr¬ ževanjem celične oblike; - v šestem poglavju je predstavljeno ključno biološko vpraša¬ nje o tem, kako celica shranjuje, uporablja in prenaša dedne informacije; - v sedmem poglavju obravnavava osnovne procese celičnega razmnoževanja in regulacijo celičnega ciklusa, celično smrt in matične celice; - osmo poglavje zajema komunikacijo in sporočanje med celi¬ cami in okoljem. Namen skript je predstavitev osnovnih konceptov v celični biologiji, ki so ključni za razumevanje delovanja organizmov. V vsakem poglavju je vključen kratek odstavek z naslovom “KAJ JE NOVEGA BRUCKI". Z vprašanji v odstavku želiva vzbuditi zanima¬ nje za študij in usmeriti študente v iskanje aktualnosti in zanimi¬ vih tem s področja celične biologije v dodatnih študijskih virih. Študirati pomeni iskati znanje kjerkoli: na predavanjih, v razpra¬ vah s kolegi, v knjižnicah, revijah, v laboratoriju, predvsem pa v naravi, ki je naše primarno okolje. Ko se porodijo vprašanja, se študij začne, odprejo se nove razsežnosti misli in idej, ki vodijo do novih odkrivanj in spoznanj. Motiv in radovednost sta gonilni 9 sili v raziskovanju in spoznavanju. Učitelj in študent sodelujeta v teh procesih in pomembno je, da se oba zavedata, da je glavni namen študija kakovostno znanje, ki omogoča ustvarjalnost. Če bodo skripta kakorkoli prispevala k lažjemu študiju, bo najin na¬ men dosežen. Kjer je volja, je tudi pot! Avtorja 10 PRVO POGLAVJE BIOLOGIJA CELICE, ZNANOST O ŽIVLJENJU CELICE Fosilov, ki bi potrdili obstoj prvih celic, ne poznamo. Umetne¬ ga življenja še ne znamo ustvariti v laboratoriju, lahko pa simu¬ liramo nekatere procese, ki vzdržujejo življenje. S pomočjo fosi¬ lov, primerjalne biologije in sodobne paleontologije smo uspeli rekonstruirati zgodnjo evolucijo živega. Stromatoliti so slojevite združbe mikroorganizmov, podobni današnjim cianobakterijam, ki pričajo o prvih prebivalcih planeta. Primerjalne biološke študije temeljijo predvsem na primerjavi podobnosti zaporedij DNA, bio¬ kemijske in strukturne analize pa jih dopolnjujejo. Novejši izsledki kažejo, da so prvi organizmi živeli v ekstre¬ mnih okoljih. Poznavanje ekstremofilnih organizmov je velikega pomena za razumevanje nastanka življenja. S simulacijo razmer skušajo astrobiologi ugotoviti, v kakšnih razmerah so živela prva bitja na zemlji in v vesolju in kako se življenje v vesolju ohranja. Slika 1.1: Portret biokemika Alexandra Ivanoviča Oparina (1894-1980), očeta teorije o izvoru življenja na zemlji (Hut- chinson Dictionary of Scientific Biography, Helicon Publicati- ons, Access Science, Mc Gravv Hill) 11 Slika 1.2: Umetniško delo Lifeorigin2, avtor Douglas Chovvn 1983, Holland (http://www.daviddarling.info/encyclopedia/ L/Iifeorigin.html) »There is no fundamental difference between a Iiving organi- sm and lifeless matter. The complex combination of manifesta- tions and properties so characteristic of life must have arisen in the process of the evolution of matter.« (Oparin, A. I. The Origin of Life. New York: Dover (1952) (prva izdajal938)) »Med živimi bitji in neživo snovjo ni bistvenih razlik. Kom¬ pleksnost pojavov in lastnosti, ki so značilne za živo, izvira iz evolucije snovi.« V 21. stoletju je biologija kot znanost o življenju izpostavlje¬ na novim zahtevam. Pomembna odkritja v genetiki in na področju molekularne bio¬ logije v zadnjih desetletjih, hiter razvoj informacijskih tehnologij in vedno večji vpliv človeka na okolje postavljajo pred biologe vedno zahtevnejše naloge. Reševanje zapletov, ki jih povzroča človek z nepremišljenim in nenadzorovanim delovanjem, zahteva nova znanja in njihovo smotrno uporabo za ohranjanje ravnotež¬ ja v naravi. Poznavanje in obvladovanje naravnih zakonitosti, ra¬ zumevanje in ohranjanje življenja niso le dolžnosti in privilegiji biologov, pač pa dolžnost vsakega človeka, ki v tem trenutku biva na zemlji. Biologija skuša odgovoriti na zelo preprosto vprašanje »Kako deluje življenje?«. Odgovor še zdaleč ni preprost. Iščejo ga 12 raziskovalci v številnih vedah in panogah, ki z načrtovanimi in po¬ novljivimi poskusi preverjajo svoje predpostavke in z ugotovitva¬ mi prispevajo kamenčke in bisere v kraljestvo znanj o življenju. Odgovor na vprašanje, kaj je življenje in kako delujejo živa bitja, lahko poiščemo s pogledom v celico. »The key to ali ultimate biological problems must, in the last analysis, be sought in the celi.« (VVilson, E. B. The Celi in Develo- pment and Heredity. 3rd ed. New York: The Macmillan Company; 1925) »Ključ do vsakega biološkega vprašanja je na koncu treba is¬ kati v celici.« POMEMBNA ODKRITJA NA PODROČJU KLASIČNE CITOLOGIJE Hooke (1665) je prvi uporabil izraz celica, opisal je pluto (Micrographia). Purkyne (1837) je definiral protoplazmo (»protoplast je celič¬ no telo«). Schleiden, Schvvann (1839) sta postavila celično teorijo (»celi¬ ca je temeljna enota organizmov«). Virchovv (185 5) je potrdil, daje celica osnova življenja (»omnis cellula e cellula«). Flemming (1879) je opisal živalske kromosome med mitozo. Chatton (1937) je razlikoval med prokariontsko in evkariont- sko celico. Gey (1951) je vzgojil prve človeške celice v kulturi (celice HeLa). Miller - Urey (1953) sta izvedla laboratorijski poskus nastanka organskih snovi - simulacija kemijske evolucije. 1.1 KAJ JE ŽIVLJENJE? Pojmovanje življenja se je spreminjalo s časom in prav tako tudi odnos do biologije. Do začetka 20. stoletja je prevladoval vi¬ talistični pogled na življenje. Vitalizem (animizem) je vse pojave povezoval z neko nadnaravno »vitalno silo«, ki biva v organizmu in usmerja njegovo delovanje. Že nekateri grški in tudi drugi fi¬ lozofi (Aristotel, Descartes) so zagovarjali mehanicistični princip nastanka življenja, ki življenje razlaga s fizikalnimi in kemijskimi zakoni. Ta pogled je v začetku 20. stoletja razvil in dopolnil nem¬ ški biolog Jacques Loeb, ki je s poskusi na jajčecih morskih ježkov pokazal, da lahko z ustreznimi kemijskimi snovmi sproži embrio¬ nalni razvoj organizma iz ene same celice. Bil je celo prepričan, da je življenje možno ustvariti v laboratoriju. S ponovnim odkritjem Mendlovih zakonov so mehanicisti našli podporo za svoje trditve, namreč da dednost usmerjajo molekule. Rezultati dela znanstve¬ nikov 19. stoletja, kot so Darvvin, Pasteur, Mendel idr., so osnova za raziskave v biologiji današnjega časa. Začetek molekularne bi¬ ologije sega v leto 1953, ko sta VVatson in Crick predstavila model 13 dvojne vijačnice DNA in s tem postavila fizikalno osnovo za Men- dlove gene, temeljne enote, na katere deluje naravna selekcija. Od tu naprej štejemo obdobje sodobne biologije, ki v raziskave s področij sistematike, anatomije, fiziologije, ekologije, evolucije in drugih vključuje novejša dognanja s področja molekularne biolo¬ gije. Odkritju strukture DNA je sledilo obdobje hitrega razvoja na področju genetike, dešifriranje univerzalnega genskega koda, se- kveniranje genomov številnih organizmov, poznavanje regulacije izražanja genov, razumevanje imunskega sistema in manipulacije genskega materiala. Raziskave na področju molekularne biologi¬ je so omogočile razumevanje kemijske narave raznolikosti, ki je osnova za naravno selekcijo, poznavanje delovanja fizioloških sis¬ temov in nenazadnje tudi razumevanje zakonitosti v ekologiji ter reševanje problemov, ki jih povzročajo nenadzorovani posegi v okolje. Če torej skušamo odgovoriti na zastavljeno vprašanje, kaj je življenje, je odgovor lahko zelo preprost ali pa skrajno zapleten. Racionalist lahko življenje definira kot lastnost, ki loči živo od ne¬ živega. Kreacionist ga definira kot lastnost, ki je božji dar. Idealist vidi življenje kot idealno priložnost ... Fizik in kemik življenje definirata, kot rezultat fizikalnih in kemijskih procesov, ki potekajo v celicah (primera: Zubay, Ori- gins of Life, 2000: »Živa bitja so visoko organizirani kemijski sistemi«, Schrodinger 1944: »Živa bitja so sistemi, ki jih vzdr¬ žuje dednost in termodinamski zakoni«). Molekularni biolog lahko življenje definira kot delovanje kom¬ pleksnih molekularnih strojev, ki jih nadzorujejo geni, v kate¬ rih je zgodovinski zapis vrste (Godvvin, 1995). Celični biolog življenje definira kot celični organizem s kom¬ pleksno kemijsko zgradbo in z univerzalno informacijo, sku¬ pno vsem živim bitjem, ki so se razvila iz »pracelice«, ki je živela pred več kot tremi milijardami let (Alberts et al. 2004). Integrativni biolog primerja živo z neživim in ugotavlja, kate¬ re lastnosti so skupne vsem živim organizmom od bakterije do človeka in kako na vse to deluje evolucija. Zelo enostavna definicija življenja, ki vključuje tudi viruse in druge genetske elemente (npr. plazmide), je nasledstvo z mo¬ difikacijo (descent vvith modification), to je sposobnost živega, da ustvarja potomstvo, ki je podobno staršem, z možnostjo priložnostnih variacij. 14 1.2. DESET (ZA)POVEDI ZA RAZLIKOVANJE ŽIVEGA OD NEŽIVEGA Živa bitja so kompleksni, visoko organizirani sistemi, zgrajeni iz celic (sl. 1.3a, b). Robert Hooke Micrographia or Some Physio/ogica/ Descriptions of Minute Bociies (1665) Scbc.nv.Xl. Slika 1.3: Rastlinske in živalske celice, a) Robert Hooke 1665, faksimile dela Micrographia, s posnetkom celičnih sten celic, ki tvorijo pluto (reprodukcija Smithsonian Institute, 1995); b) površina epitelnih celic v prebavilu rakov enakonožcev Živa bitja organizmu (sl. 1.4) tako, da se povečuje količina žive snovi v 15 Slika 1.4: Grafična risba mladiča in odraslega medveda (Robert Savannah, U.S. Fish and VVildlife Service, http://ima- ges.fws.gov) Živa bitja se z razvojem spreminjajo (sl. 1.5). Francesco Redi Esperienze intorno af/agenerazione deglinsetti (1688) [Experiments on the generation of insects} 3 % A. Slika l.S: Francesco Redi 1688, faksimile dela Esperienze in- torno alla generazione degFinsetti, s prikazom razvoja žužel¬ ke (reprodukcija Smithsonian Institution, 1995) Živa bitja presnavljajo , v njih poteka serija kemijskih reakcij razgradnje (disimilacije) in sinteze (asimilacije) s pretvorbo ener¬ gije (sl. 1.6). 16 Slika 1.6: Omrežje okrog 500 kemijskih reakcij, ki potekajo med presnovo (povzeto po Alberts et al., Molecular Biology of the Celi, 2002) Živa bitja imajo regulacijsko sposobnost ohranjanja stalnosti notranjega okolja - homeostazo (sl. 1.7). Slika 1.7: Homeostaza? Leif Saul: Biology Cartoons: Home- ostasis (1998), http://www.easternct.edu/personal/faculty/ saull/sect9/resous9/cartos9/homeos9.html 17 Živa bitja so gibljiva (sl. 1.8) . Slika 1.8: Ameba se giblje s psevdopodiji. (http://www.microscopyu.com/galleries/dxml200/amoeba- large.html) Živa bitja se odzivajo na dražljaje, pravimo, da so vzdražna (sl-91. Slika 1.9: Mesojeda rastlina z ujeto žuželko, Richard Rauh, (http://www.science-art.com/image.asp?id=55&pagename=Su ndew_capturing_insect) Živa bitja se razmnožujejo (sl. 1.10) . Slika 1.10: Grafična risba družine oposumov (Robert Savan- nah, U.S. Fish and VVildlife Service, http://images.fws.gov) Živa bitja imajo genski program , ki usmerja zgradbo, presno¬ vo in razmnoževanje in se spreminja z evolucijo (sl. 1.11). ■' Slika 1.11: Vloga teorije v biologiji, Fuller Nicolle Rager, (http://www.science-art.com/image.asp?id=3383&pagename= Theorys_Role_in_Biology) 19 Živa bitja evoluirajo, se spreminjajo v generacijah (sl. 1.12). Slika 1.12: Prikaz razvoja živih bitij: Aristotel: the “steps of nature”, or the “hierarchy of nature” (http://www.tparents.org/Library/Unification/Books/ EvolTheo/EvolTheo-Ol.htm); drevo življenja (povzeto po Brown T., Genomes 3, 2006) Vsa živa bitja imajo naštete lastnosti, a jih je težko razvrstiti po pomembnosti za definicijo življenja. Neživo ima lahko katero od navedenih lastnosti, vendar ne vseh hkrati. KAJ JE NOVEGA BRUCKI? Kako bi definirali življenje? Kam bi uvrstili viruse in pri¬ one? Poiščite nekaj virov, ki govorijo v prid življenju na drugih planetih. Od kod življenje na Zemlji? Ugotovite, kakšna kemijska spojina je PNA, in jo primerjajte z DNA. Razloži Oparinovo teorijo o nastanku življenja na zemlji. Kaj je dokazal Miller s poskusi simulacije kemijske evo¬ lucije? 1.3 KEMIJSKA ZGRADBA CELIC Vsa živa bitja imajo celično zgradbo. Molekularna biologija celice proučuje procese v celici predvsem z vidika kemijskih in fizikalnih reakcij, ki potekajo na subceličnem nivoju. Celice so iz vode, organskih molekul in anorganskih snovi. Snovi, ki jih tvo- 20 rijo živi organizmi, imenujemo biokemijske substance. Snovi, ki nastajajo med celično presnovo, so metaboliti. Enostavne molekule Osnovni elementi, ki gradijo živo snov, so C, O, N, H, ki se na različne načine povezujejo v enostavne molekule, gradnike kom¬ pleksnih organskih spojin. Enostavni ogljikovi hidrati s strukturno formulo C n (H 2 0) n so osnovna hrana celice, vir energije (glukoza) in gradniki (ribo- za, deoksiriboza) kompleksnih makromolekul. Vezani na proteine so lahko signalne molekule in označevalci za razpoznavanje med molekulami. Maščobne kisline gradijo lipide, so vir energije, pomembna sestavina fosfolipidnih membran in sporočilne molekule. Aminokisline so gradniki beljakovin in pomembne puferske spojine. Beljakovine gradi 20 osnovnih aminokislin, ki jih lahko razdelimo v štiri skupine, glede na lastnosti stranskih verig: nepo- larne (10), polarne (5), bazične (3) in kisle (2) aminokisline. Nukle¬ otidi so gradniki nukleinskih kislin, energijsko bogatih spojin in koencimov. Nukleotidi so pomembni v procesih bioloških oksida¬ cij kot skladišča energije, ki jo celica potrebuje za delovanje (ATP, GTP, CTP, TTP, UTP). Pomembni so tudi kot koencimi pri prenaša¬ nju elektronov in protonov v oksi-redoks reakcijah (nikotinamid dinukleotid NAD, nikotinamid dinukleotid fosfat NADP in flavin adenin dinukleotid FAD). Kompleksne molekule Enostavni ogljikovi hidrati se z O-glikozidno vezjo povezujejo v di- in polisaharide. Škrob in glikogen sta polimera glukoze in pomembni rezervni substanci rastlin in živali. Celuloza in hitin sta osnovna strukturna polisaharida. Sladkorji se lahko povežejo s proteini in tvorijo glikoproteine, ki pokrivajo zunanje celič¬ ne površine, medtem ko proteoglikani sestavljajo medceličnino (glikozaminoglikani, npr. heparin) in so pomembne signalne mo¬ lekule v celici. Pomembni celični glikoproteini so lektini, ki prepo¬ znavajo specifične snovi, ki vsebujejo ogljikove hidrate. Pogosti so v hemolimfi, v izločkih in plazmalemi. Fibronektini so glikopro¬ teini, ki so pogosti v telesnih tekočinah, vezivu in bazalni lamini. Pomembni so za povezavo celic in izvenceličnega matriksa. Maščobne kisline in glicerol sestavljajo trigliceride, nevtral¬ ne maščobe, ki so zelo ekonomičen vir energije v celici (dvakrat več energije na gram kot ogljikovi hidrati). Fosfolipidi, sfingo- lipidi in holesterol so gradniki celičnih membran. Fosfolipidi so iz glicerola, dveh maščobnih kislin in aminoalkohola s fosfatno skupino. Alkohol je lahko holin, etanolamin ali inozitol, nekateri fosfolipidi pa vsebujejo aminokislino serin. Sfingolipidi, ki so po¬ gosti v membranah živčnih celic (sfingomielin), imajo sfingozin namesto glicerola. Karotenoidi so pomembni rastlinski pigmenti in predhodniki vitamina A. Steroidi so signalne molekule, hormo¬ ni in gradniki membran (holesterol). Aminokisline se s peptidno vezjo povezujejo v polipeptide. Beljakovine so polipeptidi, ki so na specifičen način zviti v prosto- 21 ru. Primarno zgradbo proteina določa zaporedje aminokislin, ki ga gradijo. Sekundarna zgradba proteina nastane zaradi vodikovih vezi med določenimi odseki polipeptidne verige in je lahko v obli¬ ki vijačnice alfa ali beta nagubanega lista. Zaradi interakcij med stranskimi verigami aminokislin se funkcionalna področja prote¬ ina (domene) z različno sekundarno zgradbo z linearnimi odseki povezujejo v značilno konformacijo. To je terciarna zgradba pro¬ teina. V celici so prisotni pomožni proteini molekularni šaperoni, ki omogočajo specifično zvijanje proteinov v celicah. Beljakovi¬ ne s kvartarno zgradbo (npr. hemoglobin) so iz več polipeptidnih podenot. Beljakovine so osnovni strukturni elementi v celicah, transportne molekule, encimi, receptorji, hormoni in protitelesa. Celoten arzenal proteinov, ki nastaja v organizmu, imenujemo proteom. Dejavnost, ki se ukvarja z raziskavami celičnih ali tkiv¬ nih proteinov, se imenuje proteomika. Nukleotidi so iz dušikove baze (purini: adenin in gvanin, pi- rimidini: citozin in timin/uracil), sladkorja (riboza, deoksiriboza) in fosfatne skupine. Nukleotidi se povezujejo v nukleinske ki¬ sline s 5 '-3' fosfodiestrsko vezjo. Nukleinske kisline so informa¬ cijske molekule, informacija je kodirana v specifičnem zaporedju nukleotidov. Nukleinske kisline sodelujejo pri sintezi beljakovin kot nosilke dednih zasnov (DNA), prenašalke informacij (mRNA) in aminokislin (tRNA) ter sestavine ribosomov (rRNA). V celici stalno potekajo procesi razgradnje kompleksnih snovi v osnovne gradnike (katabolizem) in sinteza kompleksnih snovi iz osnovnih enot (anabolizem). Energija, ki se sprošča pri razgra¬ dnji (oksidaciji), se veže v energijsko bogate spojine v sklopljenih reakcijah in se porablja pri biosintezi. Snovi se v živih sistemih stalno spreminjajo, na primer ogljik v procesu dihanja prehaja iz reducirane oblike (glukoza) v oksidirano (ogljikov dioksid) in obratno pri fotosintezi. 1.4 PRVE CELICE - PROTOBIONTI Organske molekule, enostavni sladkorji, aminokisline in nu¬ kleotidi, ki so osnova živega, so nastajale v pramorju pred tre¬ mi milijardami let v atmosferi, ki je verjetno vsebovala metan, ogljikov dioksid, amoniak in vodno paro (teoriji Oparin, Haldane). Energijske pretvorbe pod vplivom UV-svetlobe in razelektritev so omogočile povezave enostavnih molekul v makromolekule, ki so jih obdale lipidne membrane in jih tako ločile od vodnega okolja. Manjše molekule (hranila) so prehajale skozi lipidni ovoj in prina¬ šale atome ter energijo. To so bili protobionti (sl. 1.13). Obdržali so se le tisti, ki so vsebovali informacije za identično replikacijo, torej nukleinske kisline. Protobiont z osnovnimi značilnostmi ži¬ vljenja je torej skupek molekul, obdanih z lipidno membrano, ki izmenjuje snovi in energijo z okoljem in se lahko replicira. Prvi bi- onti so verjetno izkoriščali nukleinske kisline kot encime za pro¬ dukcijo beljakovin. Tako so nastajale kompleksne celične struktu¬ re. Prve celice so verjetno nastale pred dvema milijardama let. 22 MIKROSFERE MEMBRANSKE VGREZNUVE Slika 1.13: Shematski prikaz protobionta (Nasif Nahle, http:// biocab.org/Protobiont.htmI) 1.5 PROKARIONTSKA IN EVKARIONTSKA CELICA Živa bitja, od preprostih enoceličarjev do kompleksno zgraje¬ nih večceličarjev, so iz celic, gradbenih in funkcionalnih enot or¬ ganizmov. Morfološka raznolikost večceličarjev je rezultat celične diferenciacije in povezav celic v tkiva ter organe. Celice so odprti sistemi, ki izmenjujejo snovi, energijo in in¬ formacije z okoljem, pri tem pa ohranjajo v svoji notranjosti čim¬ bolj stalne razmere, homeostazo. V razvoju sta se pojavila dva tipa celic, prokariontske in evkariontske. Bakterijska celica je prokariontska ali protocita (sl. 1.14), celice praživali, gliv, rastlin in živali so evkariontske celice ali evcite (sl. 1.15). Celična snov evkariontskih celic je diferencirana v jedro (nucleus) in cito¬ plazmo, ki je iz citosola, citoskeleta in celičnih organelov. Živalska celica je obdana s plazmalemo, celično membrano, ki je pogosto pokrita z izločki (kutikulo, sluzjo). Celice gliv in rastlin imajo hitinsko ali celulozno celično steno, ki vzdržuje trdnost in obliko celice. Bakterijske celice so obdane s celično steno iz pep- tiaoglikanov, imajo zrnato citoplazmo, so brez organelov in jedra. Dedni material je krožna molekula DNA (nukleotid, kromosom). Bistvene razlike v zgradbi in delovanju celic pro- in evkariontov so prikazane v preglednici 1. Strukturna kompleksnost evkariont¬ ske celice v primerjavi s prokariontsko omogoča večjo funkcio¬ nalnost, povezano z delitvijo dela, kar je bila verjetno osnova za razvoj pravih večceličarjev. 23 KAPSULA STENA DNK PLAZMALEMA ZNOTRAJCELIČNI VKUUČKI Slika 1.14: Zgradba prokariontske celice. Osnovne strukture v bakterijski celici. Na levi strani črtkane linije je s kapsulo obdana paličasta bakterija, na desni pa bakterija z bički in pili (Štrus, Splošna zoologija, 1999) Slika 1.15: Zgradba živalske celice (Štrus, Splošna zoologija, 1999). Prikazana je ultrastruktura celice, kot je vidna s transmi- sijskim elektronskim mikroskopom: J: jedro, Nu: nukleolus, P: peroksisom, MT: mikrotubuli, F: filamenti, SG: sekrecijska gra- nula, Mi: mitohondrij, C: centriola, Go: Golgijev aparat, Mp: mi- kropinocitotski vezikli, Kv: klatrinski vezikli, AER: agranulirani endoplazemski retikulum, MuT: multivezikularno telesce, G: gli¬ kogen, L: lizosom, GER: granulirani endoplazemski retikulum Spodaj: različni celični organeli, vidni s svetlobnim mikrosko¬ pom: a) Granulirani endoplazemski retikulum (Nisslova zrnca) v živčni celici, J: jedro; b) mitohondriji v epitelni celici tanke¬ ga črevesa; c) lizosomi v epitelni celici tankega črevesa; d) Golgijev aparat in sekrecijske granule v epitelni celici pan- kreasa 24 Preglednica 1: Značilnosti evkariontskih in prokariontskih celic Bakterije - strukturno preproste in biokemijsko kompleksne prokariontske celice Bakterije nas spremljajo v vsakdanjem življenju. Razlikuje¬ mo jih lahko po obliki, še bolje pa glede na presnovo. Podrobna zgradba bakterij je zelo enostavna (sl. 1.161 . Razen nekaj izjem so vse bakterije obdane s celično steno, ki jih ščiti in nadzoruje komunikacijo z okoljem. Celična stena je iz peptidoglikanov, kar je osnova za ločevanje bakterij s svetlobno mikroskopskimi me¬ todami, na osnovi barvanja po Gramu. S tehniko krioelektronske mikroskopije lahko dobro razlikujemo steno Gram pozitivnih in negativnih bakterij. Celična stena Gram pozitivne bakterije je iz debelega sloja peptidoglikana dokaj enake debeline. Citoplazma je homogene gostote in jo težko ločimo od DNA plazme. Gram ne¬ gativne bakterije, kot npr. Escherichia coli, imajo večslojno celično steno, kjer je tanek sloj peptidoglikana kovalentno vezan z zuna¬ njo membrano, ki vsebuje lipopolisharide, zasidrane v membrano z lipidi. Bakterije imajo pogosto tudi bičke in različne pritrjeval- ne strukture, ki omogočajo gibljivost ali interakcijo z gostiteljem. S transmisijskim elektronskim mikroskopom lahko opazujemo omenjene strukture, ohranitev struktur pa je odvisna od pripra¬ ve vzorca. Kljub uporabi različnih tehnik priprave je razlikovanje bakterij zgolj na osnovi ultrastrukture zelo težavno. Z uvajanjem imunocitokemijskih tehnik in označevanjem specifičnih molekul s protitelesi so možnosti za biokemijsko razlikovanje bakterij bi¬ stveno večje. 25 Slika 1.16: TEM mikrografija rikecije Rickettsia slovaca, ki se deli v celici klopa Kvasovke - strukturno preproste irLhiokemijsko kompleksne evkariontske relire Kvasovke rodu Saccharomyces so eden ključnih organizmov v celični biologiji, predvsem v raziskavah celičnega ciklusa (sl. 1.17). V živilski industriji so nenadomestljive. Ultrastrukturne raz¬ iskave celic kvasovk z uporabo metode zamrzovanja pod visokim pritiskom in kriosubstitucije ter vklapljanja v smolo so razkrile podrobno zgradbo teh biokemijsko kompleksnih evkariontov. Nad plazmalemo je celična stena iz hitina, fibrilarne strukture na zu¬ nanji površini celične stene so fimbrije iz glikoproteinov. Celično jedro je veliko in obdano z vakuolami in maščobnimi kapljami. Navadno je prisoten en sam velik mitohondrij, plazmalema je po¬ gosto nagubana. Slika 1.17: TEM mikrografija kvasovke Saccharomyces cerevi- siae 26 KAJ JE NOVEGA BRUCKI? Kdaj so se pojavili prvi evkarionti? Kako so nastale evkari- ontske celice? V literaturi poišči različne razlage za nasta¬ nek rastlinske, glivne in živalske celice. V čem je prednost evkariontov pred prokarionti? 1.6. ŽIVALSKA CELICA KOT ENOCELIČNI ORGANIZEM ALI GRADBENA ENOTA VEČCELIČARJEV Praživali - strukturno in biokemijsko kompleksne evkariontske celice Svet s prostim očesom nevidnih enoceličarjev oživi v kapljici vode, telesne tekočine ali koščku tkiva, ki jih opazujemo s sve¬ tlobnim mikroskopom. Paramecija lahko opazujemo ure in ure, ne da bi se nehali čuditi pestrosti funkcij ene same celice. Z mikroskopiranjem v temnem polju lahko sledimo gibanju paramecija in primerjamo tokovnice in vzorce gibanja posameznih osebkov ali opazujemo prehranjevanje in sledimo ciklozi prebavnih vakuol. S spreminja¬ njem ozmolarnosti okoljske tekočine lahko opazujemo delovanje kontraktilnih vakuol. In kakšen je ta svet videti z elektronskim mi¬ kroskopom? Migetalkarji so kompleksni enoceličarji s številnimi organeli, katerih zgradba in delovanje kažeta na visoko stopnjo celične diferenciacije (sl. 1.18). Celični korteks je iz pelikule, celič¬ ne membrane, pod katero je sistem sploščenih alveolov, migetalk, kinetosomov, trihocist in fibrilarnih struktur. Migetalke imajo zna¬ čilno strukturo iz mikrotubulov in koordinirano delujejo v času in prostoru. Trihociste so specializirane obrambne strukture, celični izločki, ki nastajajo kot produkt v cisternah Golgijevega aparata. Še bolj kompleksno je zgrajena kontraktilna vakuola paramecija. Voda in ioni se zbirajo v centralnem kanalu, v katerega vodijo zbi¬ ralni kanali, obdani s trakovi mikrotubulov. Ob zbiralnih kanalih je sistem kanalčkov in veziklov, ki ga označujemo kot spongiom in je del endoplazemskega retikuluma, ki zbira vodo in produkte presnove. Jedrni dimorfizem je značilnost migetalkarjev in makro- nukleus ločimo od mikronukleusa že po velikosti. Makronukleus nadzira presnovo in vzdržuje homeostazo; med konjugacijo raz¬ pade. Vsebuje številna jedrca in drobne skupke heterokromatina. Mikronukleus je pomemben za gensko raznolikost paramecijev, ki je rezultat konjugacije. V njem poteka zaprta mitoza, kromatin kondenzira v zgodnji profazi, v nadaljnjih fazah pa se formira delitveno vreteno, ki razporedi kromosome na pola znotraj jedra. Med zaprto mitozo se jedrni ovoj ohrani. Vse te kompleksne, viso¬ ko organizirane strukture omogočajo potek raznolikih funkcij, ki vzdržujejo homeostazo enoceličnega organizma. 27 Slika 1.18: Risba in TEM mikrografija paramecija z oznako celičnih organelov. Pe: peristom, Ve: vestibulum, MA: makro- nukleus, Mi: mikronukleus, Nv: prebavna vakuola, Pv: krčljiva vakuola (avtor: Volker Storch, Kurzes Lehrbuch der Zoologie, 2005) Večcelični organizmi, diferenciacija in povezava celic v tki va in ,QEgane V telesu večceličarjev so celice med seboj povezane na različ¬ ne načine: direktno so povezane z medceličnimi stiki, posredno pa s proteinskimi molekulami ali z medceličnino. Celice si izme¬ njujejo sporočila in tako ohranjajo organiziranost strukture ter preprečujejo vdor tujkov. V primeru, daje sporočanje prekinjeno, se lahko začnejo celice nebrzdano dehti, kar pripelje do deorgani- zacije in nastanka rakastih tkiv. Zelo nazoren primer sodelovanja različnih tipov celic v živalskem telesu je telesna stena ožigalkar- ja hidre (sl. 1.19), kjer so različne celice razporejene v dveh slojih in delujejo skladno, kljub temu da opravljajo popolnoma različne funkcije. Zunanja plast (ektoderm) je iz epitelnomišičnih celic, ki se krčijo in ščitijo organizem, iz ožigalnih celic knidoblastov s poudarjeno žlezno funkcijo, ki producirajo ožigalke ah knide, iz receptorskih celic, ki zaznavajo dražljaje, in iz bazalno namešče¬ nih živčnih celic, ki prevajajo impulze. Nediferencirane vmesne ah intersticielne celice so s citoplazemskimi mostički povezane s knidoblasti. Notranja plast (endoderm) iz absorpcijskih krčljivih celic z migetalkami, žleznih celic in nediferenciranih bazalnih ce¬ lic ima ključno vlogo pri presnovi in transportu snovi. 28 Slika 1.19: Shematski prikaz celične zgradbe telesne stene hi¬ dre. Epidermis ustreza integumentu, mezogleja je tanka plast veziva, gastrodermis ima vlogo prebavila (Štrus, Splošna zoo¬ logija, 1999) KAJ JE NOVEGA BRUCKI? Kdaj so se pojavili prvi večceličarji? Poišči razlage za nji¬ hov nastanek. V čem je prednost večceličnega organizma v primerjavi z enoceličarjem? Kateri je najpreprostejši danes živeči živalski večceličar? Ali obstajajo večcelični kloni? V čem so prednosti in v čem slabosti takih organiz¬ mov? Poišči in citiraj vir, ki opisuje živalsko vrsto Tyran- nonasus imperator na sl. 1.20. Slika 1.20: Risba živali vrste Tyrannonasus imperator 29 DRUGO POGLAVJE BIOLOŠKA MEMBRANA IN TRANSPORT SNOVI Prvi opisi rastlinskih celic iz 17. stoletja obravnavajo celično steno kot osnovno pregrado med celico in okoljem. Svvammerdam in Leeuvvenhoek sta prva opazovala eritrocite s svetlobnim mikro¬ skopom in svoja opažanja objavila leta 1674 v reviji Philosophi- cal Transactions of the Royal Society of London. Nageli in Cramer sta 1855 ugotavljala, da so celice ločene od okolja z membrano, ki ima posebne lastnosti. Na začetku 20. stoletja je mikrobiolog Overton izvedel nekaj enostavnih poskusov, s katerimi je poka¬ zal lipidno naravo membrane. Šele z uvedbo učinkovite metode »eritrocitnih duhkov« za pripravo membran so začeli intenzivno raziskovati membranske proteine. Vse do danes so eritrociti ostali ključni model za raziskave zgradbe in delovanja celične membra¬ ne (sl. 2.la, b). Slika 2.1: a.) SEM posnetek sesalčjih eritrocitov in hemolizira- nih celic (povzeto po Karp, Ceh and Molecular Biology, 2005) b.) Shema prikazuje različne krvne celice: a) eritrocit; b, c, d) levkociti; e) zgradba plazmaleme eritrocita (povzeto po Storch V. in Welsch U., Kurzes Lehrbuch der Zoologie, 2005) 30 POMEMBNA ODKRITJA NA PODROČJU MEMBRAN Overton, 1890: spoznal je osnovne kemijske lastnosti mem¬ brane. Gorter in Grendel, 1925: membrana je trden lipidni dvosloj. Davson in Danielli, 1935: model elementarne troslojne mem¬ brane (»unit membrane«), Robertson, 1957: dvoslojna struktura membrane z elektron¬ skim mikroskopom. De Duve, 1963: opisal endocitozo. Singer in Nicolson, 1972: model tekočega mozaika (»fluid mo- saic model«). Sackman in Neher, 1991: Nobelova nagrada za uvedbo tehnike vpete napetosti na krpici membrane (»patch clamp«). 2.1 ZGRADBA PLAZMALEME IN ENDOMEMBRAN Biološka membrana (mrenica, opna) obdaja celico (celična membrana ali plazmalema) in organele evkariontov (endomem- brane) ter omogoča prehod snovi med predelki v celici in med ce¬ lico ter okoljem. Pomembna je tudi za celično sporočanje, energij¬ ske procese, rast in gibljivost celice. Kemijska zgradba bioloških membran je precej enotna. Membrane so od 5 do 10 nm debele plasti iz fosfolipidov, holesterola, glikolipidov in različnih pro¬ teinov. Razmerje med lipidi in proteini je odvisno od tipa mem¬ brane in je lahko 3:1, 1:1 ali celo 1:3 kot v notranji membrani mitohondrija. Fosfolipidi so amfipatske molekule, ki so v vodnem okolju urejene v dvosloj tako, da so polarni (hidrofilni) deli obr¬ njeni navzven, nepolarni (hidrofobni) pa navznoter (sl. 2.2). Pri zmernih temperaturah je fosfolipidni dvosloj tekoč, pri nižjih pa je bolj viskozen in je v obliki kristalne rešetke. Viskoznost ali te- kočnost dvosloja je odvisna od števila nenasičenih maščobnih ki¬ slin, vrste fosfolipidov in količine holesterola. Več nenasičenih, krajših maščobnih kislin in manj holesterola vzdržuje tekočnost in zmanjšuje viskoznost. Fosfolipidni dvosloji so prepustni za manjše in nepolarne molekule (pline, vodo) in za molekule, topne v lipidih (lipofilne snovi, glicerol). Holesterol povečuje čvrstost membran in hkrati zmanjšuje njihovo prepustnost. Celice spremi¬ njajo tekočnost membran tako, da spreminjajo lipidne sestavine membrane. Membrane bakterijske in rastlinske celice ne vsebujejo holesterola, čvrstost celične površine vzdržujejo peptidoglikani in celuloza v celični steni. Sestavni del membrane so tudi protei¬ ni, ki so lahko razporejeni v membrani in nekovalentno povezani z lipidi (integralni, transmembranski proteini) ali pa so s šibkimi ionskimi vezmi povezani s površino lipidnega dvosloja (periferni proteini). Vloga proteinov je raznolika, lahko so strukturne mole¬ kule, encimi, receptorji ali pa delujejo kot kanalčki in prenašalci. Membranski transportni proteini so pomembni za prenos ionov, polarnih nizkomolekularnih snovi in makromolekul. Transmem¬ branski proteini so lahko enkrat prehajajoči (sl. 2.3) ali večkrat prehajajoči, iz ene ali več polipeptidnih podenot, ki v pasovih (navadno v obliki vijačnice alfa) segajo skozi fosfolipidni dvosloj. 31 Tudi proteini lahko difundirajo vzdolž membrane, vendar so veči¬ noma s posebnimi molekulami vezani na specifična mesta v mem¬ brani (domene). Slika 2.2: Zgradba celične membrane živalske celice (Štrus, Splošna zoologija, 1999) Slika 2.3: Zgradba enkrat prehajajočega transmembranskega glikoproteina. Polipeptidna veriga prečka fosfolipidni sloj kot desnosučna vijačnica alfa, oligosaharidne verige in disulfidne vezi so na zunanji strani membrane (Štrus, Splošna zoologija, 1999) Membrana je dinamična struktura, lipidne in proteinske mo¬ lekule se lahko gibljejo v različnih smereh (vrtenje, upogibanje, gibanje vzdolž membrane), redkejša pa so gibanja »flip-flop«, kjer lipidne molekule prehajajo z ene na drugo stran dvosloja. Mem¬ brana je asimetrična (sl. 2.4), saj so molekule v dvosloju različno razporejene. Molekule fosfatidilholina, sfingomielina in glikolipi- dov so razporejene na zunanji strani dvosloja, fosfatidilserina in fosfatidiletanolamina pa na citoplazemski strani membrane (sl. 32 2.5). Asimetrično razporejeni so tudi proteini in ogljikovi hidrati. Glikozilirani hormonski receptorji, signalni proteini in glikolipidi so vedno na zunanji strani membrane. Fluidnost membrane je po¬ membna lastnost, ki vpliva na njeno prepustnost. Slika 2.4: Membrana je asimetrična zaradi različne razpore¬ ditve fosfolipidov in proteinov v obeh slojih. IP: integralni protein; PP: periferni protein; Glikokaliks je iz razvejanih gli- koproteinov na zunanji strani membrane (Štrus, Splošna zoo¬ logija, 1999) ©NH3 fosfatidil-serin 0 I CH2 O COO0 CH3 CH3-J,^CH3 © f H2 H2 o CH2-CH J l (=C) l'~ = P- i -CH2 O0 O O CH2- --O O =!>- C 1 ) CH—CH2 l b O© =o fosfatidil-holin Slika 2.5: Fosfolipidi so različno razporejeni v notranjem in zunanjem sloju membrane. Fosfatidilserin je večinoma na citoplazemski strani membra¬ ne, fosfatidilholin pa na zunanji strani (povzeto po Alberts et al., Molecular Biology of the Celi, 2002) 2.2 TRANSPORT SKOZI MEMBRANO Biološka membrana je selektivno prepustna in omogoča nad¬ zorovan prehod manjših molekul, tako da vzdržuje kemijsko se¬ stavo citoplazme. Snovi prehajajo skozi membrano na tri načine. Majhne, nepolarne molekule (0 2 , C0 2 , N 2 ) prehajajo skozi membra¬ no s pasivnim transportom, ki je lahko enostavna difuzija ali 33 pospešena (facilitirana) difuzija. Molekule difundirajo v smeri koncentracijskega gradienta, skozi prostore v lipidnem dvosloju (teorija rešetke) ali skozi vodne pore. Večje, polarne molekule, npr. sladkorji in aminokisline, ter manjši ioni prehajajo hitreje s pospešeno difuzijo, ki poteka s specifičnimi prenašalnimi proteini (primer transporta glukoze skozi membrano eritrocita). Ta tran¬ sport je pasiven in poteka v smeri koncentracijskega gradienta do vzpostavitve ravnotežja. Ioni prehajajo večinoma skozi ionske kanalčke, transport je pasiven in zelo selektiven (sl. 2.6). Kanalč- ki so proteini, ki vsebujejo vodne pore, prehod je do 100-krat hi¬ trejši kot s prenašalci. Kanalčki so večinoma zaprti, odpirajo se lahko zaradi spremembe v električni napetosti membrane (nape¬ tostni kanalčki), zaradi vezave liganda (ligandski kanalčki) ali me¬ hanske spremembe na membrani (mehanski kanalčki). Aktivnost posameznih ionskih kanalčkov, lahko ugotavljamo z metodo vpe¬ te napetosti na krpici membrane (»patch clamp«). Slika 2.6: Zgradba in delovanje ionskih kanalčkov v membra¬ ni: a) napetostni ionski kanalčki; b) ligandski ionski kanalčki (Štrus, Splošna zoologija, 1999) Za razliko od pasivnega transporta je za aktivni transport snovi potrebna energija, ki izvira direktno iz metabolizma celi¬ ce (npr. hidroliza ATP). Ioni in molekule prehajajo v smeri, ki je nasprotna koncentracijskemu gradientu. Z aktivnim transportom celice vzdržujejo dinamično ionsko ravnotežje in s tem celično homeostazo. Aktivni transport ionov poteka z ionskimi črpalka¬ mi, ki so prenašalni proteini in za delovanje lahko porabljajo tudi nad 50 % dostopne celične energije (delovanje Na + -K + ATP-aze). Mehanizmi aktivnega transporta so različni (sl. 2.7). Snovi lahko prehajajo direktno, v povezavi s hidrolizo ATP (transport Na + in K + ionov) ali z vezavo fosfatne skupine (transport glukoze v bakte¬ rijah) in indirektno kot kotransport. Simport je sočasni transport obeh molekul v isti smeri, medtem ko je antiport sočasni prenos ene molekule v smeri koncentracijskega gradienta in druge mole- 34 kule v smeri, ki je nasprotna koncentracijskemu gradientu. Tran¬ sport glukoze v črevesu poteka vzajemno s transportom Na + ionov (simport), transport Na + in Ca^ ionov v srčni mišici pa poteka v nasprotni smeri (antiport). 1 2 3 UNIPORT SIMPORT ANTIPORT Slika 2.7: Aktivni transport je lahko direkten (uniport) ali in¬ direkten, ki lahko poteka v isti smeri (simport) ali v nasprotni smeri (antiport) (Štrus, Splošna zoologija, 1999) Večje hidrofilne molekule (nad 1 nm) ne morejo skozi membra¬ no. Številni hormoni, nevrotransmiterji in protitelesa prehajajo v celico z endocitozo. Proces se razlikuje od membranskega tran¬ sporta v tem, da poteka v povezavi z membranskimi receptorji, ki so v glavnem glikoproteini. Ti so povezani z encimi v membranah, ki sprožijo nadaljnje procese v celici. Membrana je pomembna tudi pri prenosu informacij med oko¬ ljem in notranjostjo celice. Številne molekule, kot so hormoni, ne prehajajo skozi membrano, ampak delujejo kot sporočevalci. S povezavo sporočevalcev, membranskih receptorjev in različnih proteinov celice komunicirajo med sabo in tako prenašajo infor¬ macije. KAJ JE NOVEGA BRUCKI? Poišči podatke v literaturi in ugotovi, kateri tipi ionskih kanalčkov so najbolj raziskani. Ugotovi, kaj so akvaporini. Katere ionske črpalke so po¬ membne v mišični celici in zakaj? Ugotovi, kaj je klatrin in kakšno vlogo ima v transportu veziklov. Opiši, kako poteka transport glukoze skozi čre¬ vesni epitel. 35 2.3 DIFERENCIACIJE CELIČNE MEMBRANE Prepoznavanje med celicami omogočajo glikoproteini in gliko- lipidi, ki na zunanji površini celice tvorijo zunanji plašč iz oglji¬ kovih hidratov, imenovan glikokaliks. Specifične kombinacije terminalnih delov ogljikovih hidratov glikokaliksa eritrocitov so osnova za razlikovanje krvnih skupin ABO. Levkociti sodelujejo pri vnetjih v tkivih tako, da se povezujejo s posebnimi proteini (selektini) v glikokaliksu endotelnih celic krvnih žil. Organizacijo celic v tkiva in organe večceličarjev omogočajo medcelični sliki, specializirani predeli celične membrane. Selek¬ tivne povezave celic omogočajo specifični adhezijski proteini (se¬ lektini, integrini, kadherini). Celice živali se direktno povezujejo na tri načine (sl. 2.8): z neprehodnimi stiki (lesnimi in septirani- mi stiki), s sidrnimi stiki (dezmosomi in priležnimi stiki) in s prehodnimi stiki (presledkovnimi stiki). Tesni stiki (zonula occludens) so povezave, kjer sta membra¬ ni sosednjih celic povezani z omrežjem razvejanih, transmem- branskih beljakovin v obliki letev (TEM), ki se na določenih me¬ stih povezujejo in tako približajo membrani sosednjih celic, da preprečujejo transport snovi skozi medcelični prostor. Taki stiki so značilni predvsem za epitelne celice vretenčarjev (manj jih je pri nevretenčarjih), in to v predelih, kjer je transport snovi skozi medcelični prostor v apikalno bazalni smeri celice omejen (črevo, ledvice, krvne žile). Dezmosomi (maculae adherens) so točkovne mehanske povezave med celicama. V tem predelu je medcelični prostor razširjen in vsebuje transmembranske proteine kadheri- ne. Na citoplazemski strani sta membrani obeh celic ojačani s pro¬ teini dezmosomskega plaka, kamor se pritrjujejo intermediarni filamenti (tonofilamenti). Drugi tip sidrnih stikov so priležni stiki, ki lahko v obliki obroča obdajajo subapikalni del celice (zonula adherens). Na priležne stike se pripenjajo snopi aktinskih filamen¬ tov. Celice se s podobno obliko sidrnih stikov lahko povezujejo tudi z izvenceličnim matriksom (na primer s fibronektinom) pre¬ ko beljakovin integrinov. Ti proteini so urejeni v dva tipa stikov: hemidezmosome (povezane z intermediarnimi filamenti) ali fo- kalne stike (povezane z aktinskimi filamenti). Posebnega fiziolo¬ škega pomena za živalska tkiva so presledkovni stiki, pri katerih sta celični membrani zbližani na razdaljo 2-4 nm. V tem predelu so številni koneksoni (nad 100), v 1,5 nm kanalčke organizirani transmembranski proteini iz družine koneksinov, skozi katere prehajajo manjše molekule (molska masa pod 1000 daltonov). Ko¬ neksoni prevajajo tudi električne impulze in so številni v predelih električnih sinaps. Za nevretenčarje so značilni septirani (pre¬ gradni) stiki (sl. 2.9), ki so zelo različni po zgradbi. Lahko so v obliki nagubanih letev, ki povezujejo sosednji celici (mehkužci, členonožci) ali pa v obliki kompleksnega tridimenzionalnega sis¬ tema paličastih struktur (ožigalkarji). 36 a Slika 2.8: Medcelični stiki: a) tesni stik (zonula occludens); b) dezmosom (macula adherens); c) presledkovni stik, neksus (macula communicans); d) pregradni (septirani) stik (Štrus, Splošna zoologija, 1999) Slika 2.9: TEM mikrografija pregradnega stika med epitelnima celicama hepatopankreasa raka enakonožca Plazmalema je na površinah polariziranih celic različno orga¬ nizirana in vsebuje specifične proteine, odvisno od celične funk¬ cije (sl. 2.10). Na apikalni strani so pogoste strukture, ki pove¬ čujejo površino v zvezi z absorpcijo ali sekrecijo. Prstasti izrastki plazmaleme na površini črevesnih celic so mikrovili, ki vsebujejo snope aktinskih filamentov, povezanih z različnimi proteini. Pose¬ ben tip mikrovilov so negibljive stereocilije, ki so pogoste struk¬ ture čutilnih celic (mehanoreceptorjev v ušesu). Bički in mige- talke (kinocilije) so večji, gibljivi izrastki plazmaleme, ki imajo 37 pri živalih enako osnovno zgradbo. Pod plazmalemo je aksonema iz devetih dvojčkov mikrotubulov na obrobju in centralnega para mikrotubulov, ki so med sabo povezani s proteini. Na bazi bička in migetalke je bazalno telo iz devetih trojčkov mikrotubulov. Gi¬ banje migetalke je posledica drsenja mikrotubulov, energija izvira iz hidrolize ATP, ki jo omogočajo molekule dineina z ATP-azno aktivnostjo, ki povezujejo dvojčke mikrotubulov. lizosom terminalno omrežje Slika 2.10: Diferenciacije celične površine in ultrastrukturne značilnosti epitelne celice živali (povzeto po Storch V. in VVelsch U., Kurzes Lehrbuch der Zoo- logie, 2005) Bazalni deli celic so pogosto izoblikovani v bazni labirint v obliki gostega omrežja kanalov, ki nastanejo z uvihanjem plaz- maleme v baznem delu celice (sl. 2.11). Značilen je predvsem za epitelne celice z intenzivnim transportom snovi v baznem delu (ledvice, Malpighijeve cevke žuželk). Na bazi epitelnih celic je ba¬ zalna lamina iz mreže proteinov med katerimi prevladuje kola¬ gen IV, ki povezuje celice z vezivom. 38 Slika 2.11: Žlezna celica hepatopankreasa raka enakonožca (ŽC) z gostim baznim labirintom in debelo bazalno lamino (BL). Ob njej je krvna celica hemocita (HE) 2.4 VZDRAŽNE LASTNOSTI MEMBRAN Vsi organizmi se odzivajo na zunanje dražljaje, zaznavanje dražljajev in prevajanje impulzov je lastnost membran vseh celic. Čutilne celice ali receptorji so specializirane za sprejemanje dra¬ žljajev, živčne celice pa zbirajo informacije in prevajajo impulze. Pomembno vlogo pri tem ima celična membrana. Zaradi razlike v koncentracijah in nabojih ionov na obeh straneh plazmaleme (elektrokemijskega gradienta) nastane na membrani električni po¬ tencial, ki je negativen zaradi prehajanja kalijevih ionov iz celice v zunanje okolje skozi kanalčke v membrani. Velikostni razred po¬ tenciala različnih celic je med -15 in -100 mV. To stanje pri mišič¬ nih in živčnih celicah imenujemo mirovni membranski poten¬ cial (MPP), ki se po vzdraženju celice lahko bistveno spremeni. Mirovni membranski potencial na membrani nevrona (od -60 do -90 mV) je posledica neenakomerne razporeditve ionov na obeh straneh plazmaleme. K nastanku tega potenciala prispevajo trije mehanizmi: elektrogena ionska črpalka, Donnanovo ravnotežje in difuzijski potencial. Najpomembnejši je difuzijski potencial, ki je posledica visoke koncentracije K + ionov v celici in visoke koncen¬ tracije Na + ionov v okolju (sl. 2.12). Koncentracijske razlike ionov so. posledica privlačnosti negativno nabitih molekul v celici, pre¬ pustnosti membrane za ione in delovanja ionske črpalke. Mem¬ brana je bolj prepustna za K + ione, ki uhajajo iz celice. Na mem¬ brani se ustvarja napetostni gradient. Zunanjost je v primerjavi z notranjostjo nabita pozitivno, membrana je polarizirana. Mirovni membranski potencial v bistvu ustreza ravnotežnemu potencialu za K + ione. Koncentracijsko razliko ionov vzdržuje Na + - K + črpalka, ki vrača Na + ione v okolje, hkrati pa črpa K + ione nazaj v celico. Črpalka za delovanje potrebuje ATP in pri nekaterih celicah lah¬ ko porabi tudi do 70 % ATP, ki nastaja v celici. Če se membranski potencial zmanjša, govorimo o depolarizaciji, če se poveča, pa 39 o hiperpolarizaciji membrane. V nasprotju z MPP, ki ga celica stalno vzdržuje, pa trenutna sprememba v napetosti na membrani sproži živčni impulz ali akcijski potencial, ki potuje po aksonu in sproži val depolarizacije vzdolž aksona. Prepustnost membra¬ ne za Na + ione se poveča do 500-krat, celična notranjost posta¬ ne pozitivna. Vrh akcijskega potenciala je dosežen, ko se stopnja depolarizacije približa vrednosti ravnotežnega potenciala za Na + ione. Hkrati se spremeni tudi prepustnost za K + ione, ki vdrejo iz celice, kar spet povzroči spremembo napetosti (repolarizacija). Končno stanje, ki usteza MPP, vzpostavi ionska črpalka. Takoj nato lahko sledi nov akcijski potencial. Akcijski potencial se širi s kon¬ stantno, za določen tip celice značilno hitrostjo. Večina poskusov, ki so pojasnili mehanizme prevajanja vzbur¬ jenj po aksonih živčnih celic, je bila izvedena na orjaških aksonih lignjev. PLAZMALEMA ZNOTRAJ ZUNAJ I Slika 2.12: Mirovni membranski potencial: pasivni in aktivni transport kalijevih in natrijevih ionov skozi membrano. Pasiv¬ ni transport skozi ionske kanalčke poteka v smeri koncentra¬ cijskega gradienta. Aktivni transport v smeri, ki je nasprotna koncentracijskemu gradientu omogoča ionska črpalka (Štrus, Splošna zoologija, 1999) 2.5 MEMBRANSKI RECEPTORJI Vse celice sprejemajo signale iz okolja in se nanje odzivajo, čutilne celice pa zaznavajo specifične dražljaje s posebnimi mem¬ branskimi strukturami, ki sprejemajo dražljaje različnih modali- tet in jih pretvorijo (transducirajo) v električne signale. 40 Številni transmembranski proteini delujejo kot receptorji in dražljaje iz celičnega okolja ali notranjosti telesa spreminjajo v informacije, ki se prenašajo preko različnih sporočevalcev. Mem¬ branski receptorji so receptorji za rastne faktorje, peptidne hor¬ mone, nevrotransmiterje, interleukine in interferone. Delimo jih v več skupin, glede na strukturne in funkcionalne lastnosti. Re¬ ceptorji, povezani z ionskimi kanalčki, so najpreprostejši in so prisotni predvsem v membranah živčnih in mišičnih celic. Ke¬ mijski signal, ki prihaja do receptorja v obliki nevrotransmiterja (acetilholina, adrenalina), se pretvori v električni signal, tako da se spremeni napetost na membrani tarčne celice, kar sproži nasta¬ nek akcijskega potenciala. Z vezavo nevrotransmiterja pride do spremembe v strukturi receptorja in to vpliva na odpiranje ali za¬ piranje ionskega kanalčka. Primer takega receptorja je nikotinski receptor za acetilholin v membrani skeletne mišične celice. Z ve¬ zavo acetilholina se odpre ionski kanalček, natrijevi ioni vdrejo v celico in depolarizirajo membrano, tako nastane akcijski potenci¬ al, ki vpliva na odpiranje kalcijevih kanalčkov, zaradi vdora kalcija v celico pride do krčenja mišičnega vlakna. Receptorji, vezani s proteinom G, se odzivajo na peptidne hormone, nevrotransmi¬ terje ter na snovi, ki jih okušamo in vohamo. Podobno delujejo tudi receptorji za vid. Številni membranski receptorji, vezani s proteinom G, imajo zelo podobno zgradbo. Večinoma so sestavlje¬ ni iz odsekov vijačnic alfa, ki sedemkrat predrejo plazmalemo. Nekateri membranski receptorji so direktno povezani z enci¬ mi v celici. To so transmembranski proteini, ki se odzivajo na ra¬ stne faktorje in snovi, ki regulirajo rast, diferenciacijo in migracije celic v živalskih tkivih. Napake v delovanju teh receptorskih poti so pogosto povezane z nastankom rakastih obolenj. Najbolj raz¬ iskana skupina takih receptorjev so receptorski proteini-tiro- zin kinaze, ki fosforilirajo tarčne celične proteine na tirozinskih stranskih verigah. Nekateri receptorji (npr. za citokine/interfero- ne) se povezujejo s citoplazemskimi proteini-tirozin kinazami ali pa z drugimi encimi v celici, kot so gvanil ciklaze, protein-tirozin fosfataze, ki se aktivirajo z vezavo liganda. Membranski receptorski proteini so razporejeni v membranah čutilnih celic in se odzivajo na specifične dražljaje ali ligande (ago- niste), npr. membranski proteini (rodopsini) v paličicah in čepkih se odzivajo na svetlobo, proteini v ciliarnih celicah notranjega ušesa se odzivajo na mehanske spremembe, receptorji v okušal- nih brbončicah jezika zaznavajo kemijsko sestavo snovi. KAJ JE NOVEGA BRUCKI? Ugotovite, kako je zgrajen in kako deluje inzulinski re¬ ceptor. V čem se razlikujeta receptorja za acetilholin v membranah skeletne in srčne mišice? Kakšne so povezave adrenalina z receptorji v membranah maščobnih in mišič¬ nih celic? 41 TRETJE POGLAVJE CELIČNI ORGANELI IN NJIHOVE FUNKCIONALNE POVEZAVE Celice, ki gradijo tkiva in organe živali vsebujejo številne ce¬ lične strukture (organele ali predelke), obdane z eno ali dvema membranama, ki ločujeta njihovo notranjost od citosola. Z nasta¬ janjem celičnih organelov je prišlo v celici do ločevanja področij s specifičnimi biokemijskimi lastnostmi in s tem do specializacije celičnih funkcij. POMEMBNA ODKRITJA CELIČNIH ORGANELOV Camillo Golgi, 1898, je opisal Golgijev aparat. Keith R. Porter, 1945, je opisal endoplazemski retikulum. Christian de Duve, 1950, je opisal lizosome. Palade, 1960, je razložil vlogo ER v procesiranju in sortiranju proteinov. Gurdon, 1966, je ugotovil, da je v jedru shranjen ves genom organizma. Sabatini in Blobel, 1971, sta postavila signalno hipotezo v sin¬ tezi proteinov. Claude, de Duve, Palade, 1974, Nobelova nagrada za raziskave strukturne in funkcionalne organizacije celice. Brovvn in Goldstein, 1974, Nobelova nagrada (1986) za razlago molekulskih mehanizmov receptorsko posredovane endo- citoze. Smith, 1984, mapiranje jedrnega lokalizacijskega signala za transport proteina skozi jedrne pore. 3.1 NOTRANJE CELIČNO OKOLJE; KEMIJSKA SESTAVA CITOPLAZME Citoplazma živalskih celic je iz citosola, celičnih organelov in dinamičnega omrežja proteinov, ki jih imenujemo celično ogrodje ali citoskelet (sl. 3.1). Celični organeli so biokemijski, strukturni in funkcionalni predelki evkariontske celice, ki so z membrano loče¬ ni od citosola (sl. 3.2). V celici je mnogo z membrano obdanih tran¬ sportnih veziklov, ki prenašajo snovi iz enega predelka v drugega. Citosol ali osnovna plazma je tekoči del citoplazme, ki lahko zavzema do 55 % celične prostornine. V citosolu so prisotne raz¬ lične organske spojine (30 % celične mase) in anorganske snovi (70 % celične mase). Voda je najpomembnejša anorganska snov v celici. V vodnem okolju potekajo biokemijske reakcije, voda je pomemben vir pro¬ tonov. Fizikalne lastnosti vode, kot so površinska napetost, kapi- larnost, gostota, toplotna kapaciteta, vplivajo na procese v celici (termoregulacija, pretok telesnih tekočin). 42 Anorganski ioni, predvsem natrijevi, kalijevi, magnezijevi, kalcijevi, kloridni, fosfatni in hidrogenkarbonatni ioni so ključni za vzdrževanje ionskega ravnovesja v celicah, regulirajo pH, vzdr¬ žujejo osmotski pritisk, omogočajo aktiven transport, dihanje, pre¬ vodnost, krčljivost ipd. Trdne mineralne snovi se koncentrirajo v celičnem matriksu in tvorijo trdna ogrodja nekaterih organizmov, ki so predvsem iz kalcijevega karbonata in silicijevega dioksida. Med ioni ima pomembno biološko vlogo predvsem kalcij. Kalcij je sekundarni sporočevalec v celici, zato je njegova koncentracija v celici nizka in ustrezno regulirana s hormoni (parthormon, kalci- tonin, vitamin D). V citoplazmi so številni proteini, ki vežejo kalcij (troponin C, kalmodulin) in regulirajo aktivnost številnih encimov. Kalcij je pomemben regulator v številnih fizioloških procesih, kot so krčljivost mišic, prenos vzburjenj, eksocitoza in oploditev. Organske spojine v celici so ogljikovi hidrati, maščobe, ste¬ roidi, maščobne kisline, nukleotidi, nukleinske kisline, aminoki¬ sline, večina je beljakovin, ki so pomembne predvsem kot encimi v celičnem metabolizmu. Beljakovine so velike molekule (molska masa med 5000 in milijon daltonov), ki v citoplazmi delujejo kot strukturne in tran¬ sportne molekule, hormoni, encimi in protitelesa. Razlikujejo se v zgradbi, delimo jih v globularne proteine in skleroproteine. Visko¬ znost citosola je odvisna od stopnje hidratacije globularnih pro¬ teinov. Skleroproteini so netopni strukturni proteini, kot so kola¬ gen, keratin, miozin. Ti proteini imajo nitasto zgradbo, večinoma v obliki vijačnice. Globularni proteini (npr. histoni, albumini) so topni, s številnimi hidrofilnimi stranskimi verigami na površini. Proteini so lahko povezani z različnimi prostetičnimi skupinami. Lipoproteini so povezani z lipidi, glikoproteini z ogljikovimi hidra¬ ti, metaloproteini vežejo ione kovin, nukleoproteini so povezani z nukleinskimi kislinami. Ribonukleinske kisline so iz ribonu- kleotidov. V celici imajo različne vloge. Informacijska RNA (mRNA) je prepisan del DNA in nosi informacijo za sintezo določenega proteina. Prenašalna RNA (tRNA) je ključna za prenos aminokislin pri sintezi beljakovin. Ribosomska RNA (rRNA) se s proteini pove¬ zuje v ribosome, ribonukleoproteinske makromolekule, v kate¬ rih poteka sinteza beljakovin. Ribosomske RNA in nekatere krajše RNA delujejo tudi kot encimi (ribocimi). Lipidi v citoplazmi so predvsem signalne molekule, rezervne snovi in vir energije. Tri¬ gliceridi so nepolarne molekule iz glicerola in maščobnih kislin, ki so večinoma iz dolgih verig in so lahko nasičene (palmitinska in stearinska m.k.) ali nenasičene (oleinska m.k.). Transport maščob¬ nih kislin poteka s prenašalnimi proteini, proste maščobne kisline so večinoma vezane z albumini. Trigliceridi, estri holesterola in karotenoidi so v celici v notranjosti lipoproteinskih kapljic, ve¬ činoma obdani s fosfolipidi in proteini. Amfipatski lipidi, kot so fosfolipidi, sfingolipidi, holesterol in proste maščobne kisline, v citoplazmi tvorijo micele ali lamelarne mielinske figure. Ogljikovi hidrati so vir energije v celici (glukoza in gliko¬ gen) in strukturni elementi v celici ter na njeni površini (hitin in proteoglikani). Med monosaharidi sta za organizme najpomemb¬ nejši pentozi riboza in deoksiriboza, ki gradita nukleotide, med heksozami pa glukoza, fruktoza in galaktoza, ki so vir energije. Oligosaharidi so iz dveh do šestih molekul monosaharidov, biolo¬ ško najpomembnejši so disaharidi maltoza, laktoza in saharoza. 43 Polisaharidi so predvsem rezervne snovi v celici, glikogen je na¬ vadno v obliki zrnc razporejen v citoplazmi. Slika 3.1: Ultrastruktura epitelne celice živali (Štrus, Splošna zoologija, 1999) Slika 3.2: Zgradba celične membrane in nekaterih celičnih or- ganelov v živalski celici: a) celična membrana; b) zrnati endo- plazemski retikulum; c) centriol; d) Golgijev aparat; e) mito¬ hondrij (povzeto po Storch V. in VVelsch U., Kurzes Lehrbuch der Zoologie, 2005) 44 3.2 JEDRO; INFORMACIJSKI IN REGULACIJSKI CENTER CELICE Delovno ali interfazno jedro je ključni organel v celicah evka- riontov (sl. 3.3). V jedru je shranjena glavnina celične DNA. Jedro je obdano z jedrnim ovojem iz dveh membran, med katerima je perinuklearni prostor, ki je povezan z zrnatim endoplazemskim retikulumom. Jedrni ovoj vsebuje komplekse por (premera do 120 nm), skozi katere prehajajo večje molekule iz jedra v cito¬ plazmo (ribosomske podenote in RNA) in v obratni smeri (različni proteini). Transport skozi pore je nadzorovan in je pomemben za regulacijo izražanja genov. Pore so sestavljene iz 50 do 100 belja¬ kovinskih molekul (sl. 3.4a,b), ki spreminjajo obliko in s tem tudi velikost kanala, skozi katerega poteka transport. Manjše molekule pasivno difundirajo skozi vodne kanale v pori, večje molekule, proteini in RNA molekule pa prehajajo aktivno. Jedrni proteini vsebujejo specifične jedrne lokalizacijske signale in se prenašajo skozi pore s pomočjo transportnih receptorjev. Nukleoplazma je po sestavi drugačna kot citosol. Vsebuje skelet iz intermediarnih filamentov in topne proteine. Obliko in mehansko trdnost jedra vzdržuje jedrna lamina, plast iz fibrilarnih beljakovin laminov ob notranji membrani jedrnega ovoja. Genski material v interfa- znem jedru je organiziran kot kromatin, ki je iz kondenzirane¬ ga, transkripcijsko neaktivnega heterokromatina, ki je navadno razporejen ob jedrnem ovoju, in iz transkripcijsko aktivnega, ne- zgoščenega evkromatina. V delitvenem jedru je DNA s proteini zgoščena v kromosome. Razporeditev kromosomov v jedru ni naključna, vsak kromosom zavzema določeno mesto, pogosto se povezujejo z jedrnim ovojem. V celičnem jedru je lahko eno ah celo tisoč jedrc ah nukleolusov. V jedrcu se sintetizirajo in pro¬ cesirajo ribosomske RNA (sl. 3.5). Iz rRNA in proteinov nastajajo ribosomske podenote, ki se transportirajo iz jedra in se v citoplaz¬ mi povezujejo v ribosome. Morfološko je jedrce iz treh delov: iz fibrilarnega centra v obliki delno kondenziranega kromatina, ki vsebuje gene za rRNA, iz fibrilarnega dela iz nitastih ribonu- kleoproteinskih molekul in iz granularnega dela, ki ga tvorijo številni ribosomalni delci v pozni fazi zrelosti. 45 Slika 3.3: TEM mikrografija epitelnih celic črevesa embrija raka enakonožca z interfaznimi (delovnimi) jedri KOMPLEKS JEDRNE PORE MOLEKULE JEDRNEGA PORNEGA KOMPLEKSA (A) 46 Slika 3.4: a) Shema jedrnih pornih kompleksov; b) elektron¬ sko mikroskopski posnetek (negativno barvanje) kompleksov jedrnih por (Štrus, Splošna zoologija, 1999) I 'v3*ftr r ' reciklaža RNK | •v> | in proteinov I m. *s . I V ' - Slika 3.5: Shema celice z jedrom in jedrcem, kjer poteka pre¬ pisovanje rRNA in nastajanje ribosomskih podenot (Štrus, Splošna zoologija, 1999) Mitohondriji proizvajajo večji del celične energije z oksida- tivno razgradnjo ogljikovih hidratov in lipidov ter sintezo ATP v procesu oksidativne fosforilacije. Mitohondriji (sl. 3.6) so veliki celični organeli s premerom enega mikrometra in dolžino od enega do pet mikrometrov. So različnih oblik in zelo spremenljivi. Imajo lastno DNA, ki vsebuje informacije za sintezo nekaterih encimov oksidativne fosforilacije in gene za rRNA ter tRNA. Rezultati sekvenčne analize mitohon- drijske DNA so pokazali, da je zelo podobna DNA znotrajceličnih bakterij rikecij. Večji del mitohondrijskih proteinov je kodiran v jedrni DNA, sintetizirajo se v citoplazmi in se transportirajo sko¬ zi mitohondrije s pomočjo posebnih prenašalcev. Mitohondriji so obdani z dvema membranama, med katerima je medmembranski prostor, ki vsebuje predvsem encime za fosforilacijo nukleotidov. Zunanja membrana je neselektivna in prepustna za večino manj¬ ših molekul, vsebuje proteine porine, ki so podobni poram v bak¬ terijski membrani. Notranja membrana je selektivno prepustna in oblikovana v kriste ali cevke, v primerjavi z zunanjo membrano 3.3 MITOHONDRIJI; CELICNE ELEKTRARNE 47 vsebuje veliko proteinskih kompleksov, ki sodelujejo v transportu elektronov in oksidativni fosforilaciji. Notranjost mitohondrija za¬ polnjuje matriks, ki vsebuje encime Krebsovega ciklusa, encime, ki sodelujejo v p oksidaciji maščobnih kislin, ribosome, intramito- hondrijska zrnca ter krožno DNA. Notranja membrana mitohondri¬ ja vsebuje encime dihalne verige in ATP sintazo, ki sintetizira ATP (oksidativna fosforilacija) v odvisnosti od protonskega gradienta med matriksom in medmembranskim prostorom (kemiosmotsko sklapljanje). Mitohondriji so številni v celicah z intenzivnim tran¬ sportom snovi ali v celicah z bogato sintezo maščob iz ogljikovih hidratov. Veliko jih je tudi v mišičnih celicah (sarkosomi). V celi¬ cah nekaterih enoceličarjev jih je lahko več sto tisoč, v endotel- nih celicah jih je celo manj kot sto. Nekatere praživali so brez mitohondrijev. V nekaterih, predvsem anaerobnih enoceličarjih so pogosti hidrogenosomi, ki so obdani z enojno membrano. V njih s pomočjo encima hidrogenaze nastaja vodik. Razporejanje mitohondrijev omogočajo mikrotubuli in je odvisno od procesov, ki potekajo v celici. Ker imajo mitohondriji lastno DNA, se njihov genski material z delitvijo ohranja. Dedujejo se po materini strani, ker med oploditvijo spermijev mitohondrij ne prodre v jajčno celi¬ co ali pa se razgradi. Po endosimbiontski teoriji naj bi mitohondri¬ ji nastali iz aerobnih prokariontov, ki so se simbiontsko povezali z večjimi heterotrofnimi celicami. To potrjujejo njihove značilnosti, kot so specifična zgradba membran, prisotnost in sestava dednega materiala in posebni ribosomi. Nekatere hipoteze predpostavljajo, da izvirajo iz plazmidov, ki so se vključili v celice in se razvili v kompleksne oblike. Slika 3.6: Kristni tip mitohondrija iz epitelne celice podgane (Alberts et al., Molecular Biology of the Celi, 2002) 48 3.4 PEROKSISOMI; CENTER CELIČNIH OKSIDACIJ IN RAZSTRUPLJANJA Peroksisomi so celični organeli, v katerih potekajo oksidacij- ski procesi. Vezikli velikosti od 0,2 do 0,5 pm so obdani z enojno membrano in vsebujejo okrog 50 različnih encimov. Ker pri oksi¬ dacijah v celici nastaja strupen vodikov peroksid, je pomembna prisotnost encima katalaze, ki razgrajuje peroksid. V peroksiso- mih so pogosti kristalni vključki urat oksidaze, ki razgrajuje soli urične kisline (sl. 3.7). Veliko peroksisomov je v jetrnih in ledvičnih celicah vretenčarjev. V njih potekajo oksidacije maščobnih kislin, deaminacija aminokislin, oksidacija dušikovih baz, ki nastanejo iz nukleinskih kislin, oksidacija strupenega vodikovega peroksi¬ da, ki nastaja med presnovo. Peroksid, ki nastaja v peroksisomih, se lahko uporablja za nadaljnje oksidacije snovi, npr. alkohola in fenolov (razstrupljanje). Peroksisomi sodelujejo tudi v biosintet- skih procesih, sintetizirajo se lipidi, holesterol in plazmalogeni (posebni fosfolipidi v srcu in možganih). Encimi peroksisomov se sintetizirajo na polisomih v citosolu in prenašajo v peroksisome. Čeprav nimajo lastne DNA kot mitohondriji, se razmnožujejo z delitvijo. Slika 3.7: Elektronskomikroskopski posnetek treh peroksiso¬ mov v jetrih podgane. Dva vsebujeta izrazit nukleoid, ki vse¬ buje oksidacijske encime (povzeto po Alberts et al., Molecular Biology of the Celi, 2002) 49 3.5 ENDOPLAZEMSKI RETIKULUM; PROIZVODNJA PROTEINOV IN LIPIDOV, LOGISTIČNI IN TRANSPORTNI CENTER CELICE Endoplazemski retikulum (sl. 3.8) prepreda celico kot obse¬ žno omrežje cistern in kanalov, s številnimi transportnimi vezikli. Omrežje je povezano z jedrnim ovojem, njegovo prostorsko ure¬ ditev v celici pa vzdržujejo številni mikrotubuli. Endoplazemski retikulum je morfološko in funkcionalno iz raznolikih predelov. Zrnati ali granulirani endoplazemski retikulum (GER) je ve¬ činoma oblikovan v cisterne in ima na površini membrane številne ribosome, tu se sintetizirajo, modificirajo in transportirajo mem¬ branske in sekrecijske beljakovine. V prehodnem delu retikuluma se odcepljajo vezikli, ki potujejo v Golgijev aparat. Citoplazemski proteini, ki ostanejo v celici, se sintetizirajo v citoplazmi na pro¬ stih ribosomih (polisomih), povezanih z mRNA. Gladki ali agra- nulirani endoplazemski retikulum (AER) je v obliki kanalov in ni povezan z ribosomi. Njegove funkcije so predvsem biosinteza fosfolipidov in steroidnih hormonov (v celicah spolnih in endokri¬ nih žlez) ter razstrupljanje (v jetrnih celicah poteka hidroksilacija strupov, kijih katalizirajo oksidaze v membrani ER). Specializirana oblika AER je sarkoplazemski retikulum (SER) v prečno progastih mišičnih vlaknih. V sarkoplazemskem retikulumu, ki mrežasto ob¬ daja posamezne miofibrile, se kopičijo kalcijevi ioni, ki regulirajo krčenje mišičnih vlaken. CISTERNA Slika 3.8: Kanali agranuliranega (AER) in cisterne granulirane- ga endoplazemskega retikuluma (GER) (povzeto po Alberts et al., Molecular Biology of the Celi, 2002) Sinteza membranskih in sekrprijskih proteinov ter proteinov za lizosome Proteini, ki se sintetizirajo na ribosomih, vezanih na membra¬ no ER, se v ta organel transportirajo kotranslacijsko. Sinteza vseh proteinov se začne na ribosomih v citosolu. 50 Sekrecijski proteini so označeni s signalnimi zaporedji iz pri¬ bližno 20 aminokislin. Pri kotranslacijskem transportu to zapo¬ redje prepoznajo delci SRP (iz polipeptidov in RNA), ki ustavijo sintezo polipeptida, ko se vežejo na ribosom in ga usmerijo na receptor SRP, ki je v membrani ER. Ribosom se veže na transloka- cijski kompleks v membrani ER, delec SRP pa se sprosti z riboso- ma. Polipeptid vstopi skozi kanalček v membrani (translokon) v notranjost ER. V nadaljevanju encim signalna peptidaza odcepi si¬ gnalno zaporedje in polipeptid se sprosti v lumen ER. Membranski proteini se ne sprostijo, ampak ostanejo zasidrani v membrani (sl. 3.9). Postranslacijski transport proteina poteka brez posredovanja SRP, skozi poseben proteinski kompleks, povezan s translokonom v membrani. Proteini v lumnu ER se nato s pomočjo šaperonov zvijejo v ustrezno konformacijo, glikozilirajo (dodajo se sladkorji) in podenote se povežejo. Pravilno zviti in sestavljeni proteini se transportirajo naprej v Golgijev aparat ali ostanejo funkcionalni v ER, drugi pa se razgradijo. Pomembna funkcija ER je kontrola kvalitete proteinov, torej prepoznavanje nepravilno zvitih pro¬ teinov in usmeritev v razgradnjo. Slika 3.9: Sinteza glikoproteinov v GER in transport skozi sis¬ tem endomembran do plazmaleme (povzeto po Karp, Celi and Molecular Biology, 2005) zunanjost plazemska membrana membrana vezikla z 3 51 3.6 GOLGIJEV APARAT; PROCESIRANJE IN RAZVRŠČANJE CELIČNIH PRODUKTOV Golgijev aparat je membranski kompleks (sl. 3.10), sestavljen iz sploščenih cistern, naloženih v obliki skladovnice, in številnih veziklov. Takih skladovnic je lahko le nekaj ali pa več tisoč, od¬ visno od tipa celice. Golgijev aparat je polarni organel (sl. 3.11). Na konveksni, nezreli strani, ki jo tvorijo cisterne cis, je povezan z endoplazemskim retikulumom, kjer so v predelu ERGIC številni prehodni vezikli, ki izmenjujejo snovi med obema organeloma. Membrana je v tem delu tanjša (6 nm) in podobna membrani ER. Ta del Golgijevega aparata je prva sortirna postaja, t. i. omrežje cis (predel CGN), kjer se proteini vračajo v ER ali pa nadaljuje¬ jo pot v druge dele Golgijevega aparata. Konkavna ali zrela stran Golgijevega aparata, ki jo tvorijo cisterne trans, je bližje plazmale- mi, tu se odcepljajo številni sekrecijski vezikli, ki vsebujejo gliko- proteine. Membrana je v tem delu debelejša (10 nm). Med obema stranema so medialne cisterne, med katerimi poteka intenzivna izmenjava veziklov. Polarnost Golgijevega aparata je povezana s transportom glikoproteinov in encimov, ki nastajajo v ER. V prede¬ lu omrežja trans (predel TGN) so pogoste povezave cistern in mi- krotubulov, ki povezujejo Golgijev aparat, ER in lizosome v sistem GERL. Pri prehodu skozi Golgijev aparat se sladkorne komponente glikoproteinov in glikolipidov modificirajo (glikozilacije), v pre¬ delu omrežja trans pa se proteini sortirajo in razporejajo v speci¬ fične razdelke. Različne označevalne molekule (manoza 6-fosfat) določajo in razporejajo encime za lizosome, sekrecijske produkte in beljakovine, ki se vračajo nazaj v ER (sekvenca KDEL). V sistemu GERL nenehno poteka proces recikliranja membran, kjer procesi endocitoze kompenzirajo povečanje plazmaleme zaradi sekrecije z eksocitozo. Kako poteka transport glikoproteinov med posame¬ znimi deli Golgijevega aparata, še vedno ni popolnoma jasno, zelo verjetno gre za kombinacijo transporta z vezikli in zorenja ter gi¬ banja cistern v smeri od cis proti trans delu Golgijevega aparata. Slika 3.10: a) Shema Golgijevega aparata iz večih diktiosomov (Štrus, Splošna zoologija, 1999); b) TEM mikrografija diktiosoma v žlezni celici embrija raka enakonožca 52 O O SEKRECUSKI VEZIKLI OMREŽJE TGN CISTERNE TRANS MEDIANE CISTERNE CISTERNE CIS OMREŽJE CGN PREHODNI VEZIKLI ZRNATI ENDOPLAZEMSKI RETIKHLIM Slika 3.11: Shematski prikaz polarne ureditve Golgijevega aparata (Štrus, Splošna zoologija, 1999) Sekrecijska pot proteinov iz Golgijevega aparata Proteini se v omrežju TGN sortirajo in usmerjajo v različne tipe transportnih veziklov. S konstitutivno sekrecijo se transportirajo glikoproteini in gli- kolipidi, namenjeni v plazmalemo, in tisti proteini, ki se stalno izločajo iz celice. Z regulirano sekrecijo se pod vplivom različnih signalov iz okolja izločajo sekrecijski proteini v sekrecijskih ve- ziklih, ki se kopičijo v celici. Primer regulirane sekrecije je izloča¬ nje hormonov iz endokrinih celic in prebavnih encimov iz žleznih celic pankreasa. Najbolj raziskan transport proteinov iz omrežja TGN je selektiven transport encimov v lizosome. 3.7 LIZOSOMI; PREBAVNI CENTRI CELICE Lizosomi so vezikli, obdani z membrano, ki vsebujejo hidrolit- ske encime za razgradnjo proteinov, nukleinskih kislin, ogljikovih hidratov in lipidov. Osnovni funkciji lizosomov sta heterofagija, razgradnja snovi, ki vstopajo v celico z endocitozo, in avtofagi- ja, razgradnja lastnih snovi in nefunkcionalnih celičnih organelov. Oblika in funkcija lizosomov sta zelo raznoliki, odvisno od struk¬ ture snovi, ki jo prebavljajo (sl. 3.12). Primarni lizosomi so majh¬ ni vezikli, ki vsebujejo kisle hidrolaze, encime, ki delujejo v kislem okolju (pH = 5). Nastajajo z odcepljanjem veziklov v TGN predelu Golgijevega aparata. Hidrolitski encimi se v obliki cimogenov (ne¬ aktivnih predhodnikov encimov) sintetizirajo v GER in s transpor¬ tnimi vezikli potujejo v Golgijev aparat, kjer se povežejo z ma- noza 6-fosfatnimi skupinami (označevalci za lizosomske encime). 53 V receptorsko posredovanem procesu brstijo iz membrane Golgi- jevega aparata s klatrinom označeni vezikli, v katerih se encimi aktivirajo, označevalci pa se odcepijo in reciklirajo. Na specifična mesta jih usmerjajo posebni proteini na zunanji membrani lizo- soma. Kislo okolje v notranjosti lizosoma zagotavljajo specifični proteini v membrani lizosoma, ki delujejo kot protonske črpalke. Sekundarni lizosomi so lahko avtofagosomi ali heterolizosomi. Heterolizosomi nastanejo z združevanjem primarnega lizosoma in endosoma ali pa z združitvijo primarnih lizosomov in fagoso- mov (prebavne vakuole), ki pridejo v celico s fagocitozo. Endosom vsebuje snovi, ki pridejo v celico s klatrinskimi vezikli, z recep¬ torsko posredovano endocitozo. Po prebavi v lizosomu pogosto ostanejo nepredelane snovi, to so terciarni lizosomi (telolizo- somi) ali rezidualna telesa. Lizosomi imajo v celici pomembne funkcije, saj so regulatorji celične presnove. Genetsko pogojene motnje v delovanju lizosomov so vzrok za številne bolezni kopi¬ čenja nerazgrajenih substratov. Slika 3.12: a) Shematski prikaz nastajanja lizosomov in endoci- totskih procesov v celici (Štrus, Splošna zoologija, 1999); b) TEM mikrografija sekundarnih lizosomov v žlezni celici he- patopankreasa rakov enakonožcev 54 3.8 ENDOCITOZA IN EKSOCITOZA; TRANSPORT SNOVI Z VEZIKLI Eksocitoza ali transport snovi iz celice lahko poteka s kon¬ tinuirano ali regulirano sekrecijo. Z eksocitozo se izločajo tudi nerabne snovi iz celice. V obratni smeri poteka endocitoza, spre¬ jem snovi, ki ne prehajajo skozi celično membrano. S fagocito- zo sprejema celica trdne delce velikosti nad 0,5 mikrometra (npr. bakterije in viruse). Proces poteka tako, da se plazmalema izviha na mestih, kjer se nahaja delec, ga obda in vključi v vezikel (fa- gosom). Fagosom se zlije z lizosomom v fagolizosom in delec se prebavi. Na tak način se hranijo enoceličarji in tako delujejo šte¬ vilni makrofagi v našem obrambnem sistemu. Fagocitozo stimu¬ lirajo posebni receptorji v plazmalemi (fagociti tako prepoznajo tujke obdane s protitelesi). Pinocitoza je stalen transport tekočin v celico, ki poteka tako, da se s celične površine odcepljajo manjši vezikli, ki prenašajo zunajcelično tekočino v celico. Receptorsko posredovana endocitoza (sl. 3.13) poteka tako, da se molekule ligandi (hormoni, rastni faktorji, encimi) vežejo na specifična me¬ sta v membrani, kjer so receptorji zbrani v klatrinskih jamicah. Na citoplazemski strani jamice je membrana ojačana s proteinom klatrinom. Na tem mestu se s pomočjo posebnih proteinov, ki ve¬ žejo GTP, odcepi vezikel, obdan s klatrinom, ki v celico zelo hitro prenese večje količine molekul. Molekule se v endosomih sprosti¬ jo, receptorji pa se z vezikli lahko vrnejo in vključijo v membrano. Endosomi so z membrano obdani predelki, v katerih se zbirajo snovi, ki vstopajo z endocitozo. Zgodnji endosomi so tubularne strukture, razporejene ob površini celice, s kislim pH v notranjo¬ sti organela. Delujejo kot sortirni organeli, od koder snovi preha¬ jajo v lizosome ali nazaj na membrano. Pozni endosomi ležijo ob jedru in se zlivajo z lizosomi. Najbolj raziskan model za razume¬ vanje receptorsko posredovane endocitoze je transport holestero¬ la v sesalčje celice. Holesterol se v krvi prenaša kot lipoproteinski kompleksi (delci LDL). Celice sprejemajo delce LDL z receptorsko posredovano endocitozo. Ko pride LDL v lizosome, se holesterol sprosti, receptorji za LDL pa se iz zgodnjih endosomov vrnejo v plazmalemo. V procesih endo- in eksocitoze sodelujejo številni vezikli, ki prenašajo molekule v celico in iz nje ter posredujejo med celični¬ mi organeli. Za prenos molekul iz vezikla v celični organel je po¬ memben proces zlivanja membran. Transportni vezikli vsebujejo specifične transmembranske proteine SNARE, ki se povezujejo s proteini v membrani tarčnih organelov in omogočajo zlitje mem¬ bran. 55 LDL RECEPTOR LDL Slika 3.13: Receptorsko posredovana endocitoza lipoprote- inskega delca LDL. Transport poteka s klatrinskimi vezikli z recikliranjem receptorjev LDL in plazmaleme (Štrus, Splošna zoologija, 1999) KAJ JE NOVEGA BRUCKI? Ugotovite, kaj je vzrok za povečane količine holesterola v krvi pri bolnikih z družinsko hiperholesterolemijo (FH). Ali se vsi receptorji za ligande po endocitozi reciklirajo? Poišči primere, kjer se receptorji razgradijo, in razloži, zakaj. Ugotovi, kaj so proteini SNARE in kakšno vlogo imajo pri zlivanju membran. 56 ČETRTO POGLAVJE PRESNOVA IN ENERGIJSKI PROCESI V CELICI 4.1 PROCESI PRESNOVE, DELOVANJE ENCIMOV IN VITAMINOV Presnova ali metabolizem je celota kemijskih reakcij v celi¬ ci. Celice so odprti sistemi in vzdržujejo dinamično ravnotežje ali homeostazo. Za učinkovito presnovo je nujna izmenjava snovi med celico in okoljem, ki poteka skozi celično površino ali skozi specializirane organele. Z razgradnjo snovi, ki jih celice dobijo s hrano in oksidacijo, se sprošča energija, proces imenujemo kata- bolizem. V procesih sinteze ali anabolizma se energija porablja za nastanek celici lastnih snovi. Energijsko bogate snovi se v ce¬ lici razgradijo v procesih bioloških oksidacij, kjer se sprošča energija. Tvorba in poraba energije med presnovo sta osnovni za delovanje celic. Največ energije se sprošča pri oksidaciji maščob (39 kj/g), pri oksidaciji sladkorjev in beljakovin pa manj (17 kj/g). Oksidacije lahko potekajo aerobno, v prisotnosti kisika, ali ana¬ erobno, brez kisika. Energija, ki se pri tem sprošča, se pretvori v energijsko bogate vezi v molekulah, kot so nukleozid fosfati (ATP, GTP), ali v ionske gradiente. Intenziteta presnove je med organizmi različna. Počasne in sesilne živali imajo zelo nizek metabolizem, živahne in gibljive pa visokega. Z respiracijskim kvocientom ^š<^\ n. h-n .. " f 1 * 1 GVANIN Slika 6.1: Shematski prikaz molekularne zgradbe DNA (Štrus, Splošna zoologija, 1999) Pri evkariontih se DNA nahaja v jedrih celic v obliki linearnih kromosomov. Teh je na primer pri človeku 46, pri čemer jih polovi¬ co podedujemo po očetovi in polovico po materini strani. Skupna dolžina DNA vseh 46 kromosomov diploidne človeške celice je približno 2 m. Ker je omenjena količina DNA omejena na prostor celičnega jedra s premerom približno 10 pm, mora biti DNA zelo zgoščena. Zgoščevanje DNA v kromatin poteka v več stopnjah, kjer se DNA povezuje s histoni in nehistonskimi proteini. V prvi stopnji kondenzacije se dvojna vijačnica DNA tesno navije okoli oktamera histonskih proteinov in oblikuje strukturo, imenovano nukleosom (sl. 6.2). Tesno navitje je posledica aminokislinske sestave histonov (arginin in lizin), ki jim daje pozitiven naboj in s tem privlačnost z negativno nabito DNA. V nukleosomu so histo¬ ni oblikovani v oktamere, ki jih tvorita po dve molekuli histonov tipa H1A, HIB, H2 in H4. Okoli oktamera je približno enainpolkrat navit del DNA dolžine približno 150 baznih parov. Med dvema sosednjima histonoma so odseki povezovalne DNA (»linker DNA«) dolžine približno 60 baznih parov. Tako organizirana DNA daje videz verižice z razmaknjenimi nukleosomi (»beads on string«), V drugi stopnji kondenzacije se peti tip histona, imenovan HI, veže na prosto DNA med nukleosomi ter jih poveže v kromatinska vlakna premera 30 nm, imenovana tudi solenoidi. V naslednjih stopnjah nehistonski proteini omogočijo dodatno zvijanje sole- noidne strukture najprej v spiralasto obliko, kasneje pa v tvorbo izredno zgoščene (supernavite) oblike. 77 del dvojne vijačnice DNA niz nukleosomov vezava nukleosomov in histonov H1 v solenoide nezgoščen del kromosoma zgoščen del kromosoma celoten metafazni kromosom 2n m 1 T 11 nm t I 30 nm I f 300 n m 1 700 nm I T 1400 nm 1 Slika 6.2: Stopnje kondenzacije kromatina (povzeto po Al- berts et al., Essential Celi Biology, 2004) V jedrih interfaznih celic je kromatin v dveh oblikah. Evkro- matin je nezgoščena oblika kromatina, ki omogoča dostopanje transkripcijskim encimom do DNA, s katere se prepisuje dedna informacija. Heterokromatin pa je zelo zgoščena in zato tran- skripcijsko neaktivna oblika kromatina. Ta je zaradi gostote na mikrografijah videti temnejši od evkromatina in se navadno raz¬ poreja ob notranji strani jedrnega ovoja. Tik pred celično delitvijo pride do dodatne kondenzacije kro¬ matina, ki privede do nastanka metafaznih kromosomov, ki so vi¬ dni s svetlobnim mikroskopom. V tej fazi je DNA celice podvojena, zato je vsak od kromosomov sestavljen iz dveh enakih kromatid. Ti se ob delitvi razporedita v hčerinski celici in zagotovita, da vsa¬ ka prejme celotno garnituro kromosomov materinske celice. Celice evkariontov so praviloma diploidne in vsebujejo dvoj¬ no garnituro kromosomov, urejeno v homologne pare, pri čemer en kromosom v paru podedujemo od matere in drugega od očeta. Metafazni kromosomi evkariontov imajo nekatere strukturne zna¬ čilnosti, ki omogočajo njihovo razlikovanje in oblikovanje vrstno specifičnih kromosomskih kart ali kariotipov. Kromatidi sta med seboj povezani na mestu centromera ali primarnega zažetka 78 (sl. 6.2). Tik ob centromeru je na kromatin vezan proteinski kom¬ pleks, imenovan kinetohor, na katerega se pritrjujejo mokrotu- buli delitvenega vretena. Končni deli kromatid so telomere, ki ohranjajo strukturno stabilnost koncev DNA v kromosomu. Telo¬ mere se pri večini celic z vsako delitvijo krajšajo in s tem omejuje¬ jo število celičnih ciklov. Tako preprečujejo nekontrolirano delitev celic, ki lahko privede do nastanka raka. Centromer in telomere tvorijo daljši nekodirajoči deli DNA v obliki ponavljajočih se se¬ kvenc. Geni za rRNA so na kromosomu razporejeni v predelu nu- kleolus organizatorja. Pri večini prokariontov je DNA v obliki krožnega kromosoma. Ta se na določenem mestu pripenja na celično membrano, preo¬ stanek pa se v obliki zgoščenega nukleoida nahaja prosto v cito¬ plazmi prokariontske celice. Prokarionti nimajo histonov, zato pri kondenzaciji nukleoidne DNA sodelujejo drugi histonom podobni proteini. Njihova količina in z njo povezana stopnja kondenzacije DNA je pri prokariontih DNA bistveno manjša kot pri evkariontih. Prokarionti tudi nimajo delitvenega vretena. Enakomerno razpore¬ janje kromosomov v hčerinski celici ob delitvi prokariontov zato omogočijo drugi mehanizmi. Podvojena kromosoma sta pritrjena na celično membrano in posebni proteini omogočijo razporeditev posameznega kromosoma v vsako prokariontsko hčerinsko celi¬ co. Vso dedno informacijo nekega organizma imenujemo genom. Pri evkariontskih organizmih, kjer se DNA ne nahaja samo v jedru, ampak tudi v mitohondrijih in pri rastlinah tudi v kloroplastih, zato razlikujemo jedrni, mitohondrijski in kloroplastni genom. Pri diploidnih organizmih je genom nabor dedne informacije enojne (haploidne) garniture kromosomov, npr. genom človeka je iz 23 kromosomov. Genom sestavljajo geni in nekodirajoča zaporedja DNA. Gen je temeljna enota dednega materiala, ki ima zapis za genski produkt. Gen se nahaja na določenem mestu v kromosomu - kro¬ mosomski (genski) lokus. Če ima nek gen več različic, jih imenu¬ jemo aleli, na primer gena istega lokusa na homolognih kromo¬ somih sta alela. Genski produkt gena je lahko mRNA, ki se nato prevede v aminokislinsko zaporedje (strukturni geni), rRNA, ki tvori ribosome (ribosomski geni), tRNA, ki igra ključno vlogo pri sintezi proteinov, ali druge molekule RNA, ki so pomembne pri regulaciji izražanja genov. Med nekodirajoča zaporedja RNA uvr¬ ščamo regulacijska zaporedja. Ta se ne prepisujejo, temveč služi¬ jo encimom in drugim proteinom za označevanje razpoznavnih mest za podvajanje, prepisovanje, popravljanje in druge procese na DNA. Preostanek genoma je sestavljen iz nekodirajoče DNA, katere funkcija še ni povsem pojasnjena, kljub temu da tvori ve¬ čino evkariontskih genomov (pri človeku na primer od 80 do 90 % celotnega genoma). V nekodirajoči DNA najdemo tudi krajša pona¬ vljajoča se zaporedja nukleotidov. Ta so lahko ponovljena tudi več milijonkrat in se imenujejo satelitska DNA. Nekodirajoče dele DNA najdemo tudi znotraj evkariontskih genov. Imenujejo se introni in se pred prehodom mRNA iz jedra v citoplazmo izrežejo. Kodi- 79 rajoči deli genov eksoni pa tvorijo mRNA strukturnih genov in se prepisujejo v aminokislinska zaporedja. Tudi pomen intronov ni v celoti pojasnjen. Po vsej verjetnosti je njihova prednost v lažji rekombinaciji delov DNA, ki kodirajo isti protein, kar omogoča hi¬ trejšo evolucijo genov in z njo povezano sposobnost prilagajanja. Poleg tega različno izrezovanje intronov omogoča nastanek različ¬ nih mRNA iz ene same prekurzorske mRNA (v nadaljevanju). Najmanjši genom med prostoživečimi organizmi imajo bakte¬ rije rodu Mycop\asma, kije iz manj kot 600 000 nukleotidov, med¬ tem ko je velikost genoma večine bakterij nekaj milijonov nukle¬ otidov (sl. 6.3). Genomi evkariontov so bistveno večji, saj večina poznanih evkariontskih genomov, vključno s človeškim, obsega med 10 8 in 10 10 nukleotidov. Velikosti evkariontskih genomov so zelo različne. Tako je na primer genom kvasovk velik le 10 7 nu¬ kleotidov, medtem ko ta pri nekaterih amebah, rastlinah in ribah obsega celo več kot 10 11 nukleotidov, kar kaže, da velikost genoma ne odraža kompleksnosti organizma. K velikim razlikam med ge¬ nomi prokariontov in evkariontov poleg večjega števila struktur¬ nih genov pri slednjih prispeva zlasti odsotnost intronov pri pro- kariontih ter velike količine nekodirajoče DNA pri evkariontih. MEHKUŽCI RIBE HRUSTANČNICE I RIBE KOSTNICE DVOŽIVKE PLAZILCI PTICE SESALCI morski pes žaba I človek pupek 10 5 i mm 10 6 i 11 mu 10 7 i i mm 10 8 I I Milil 10 9 10 10 i Mimi 10 11 I I Hilli 10 12 Slika 6.3: Primerjava velikosti genomov nekaterih organiz¬ mov (povzeto po Alberts et ah, Essential Celi Biology, 2004) KAJ JE NOVEGA BRUCKI? Kaj določa prostorsko zgradbo nukleinskih kislin? Poišči podatke o poskusih, s katerimi so raziskovalci F. Grifith, O. Avery, M. McCarty in C. MacLeod opredelili vlogo DNA. Kateri evkariontski genom je bil prvi sekveniran? Primer¬ jaj število genov v genomu bakterije E. coli, vinske mu¬ šice in človeka. Ugotovi, kako znanstveniki poimenujejo gene. 80 6.2 IZRAŽANJE GENSKE INFORMACIJE (EKSPRESIJA GENOV) Zaporedja nukleotidov v strukturnih genih DNA kodirajo li¬ nearna zaporedja aminokislin v proteinih. Skupina treh zapore¬ dnih nukleotidov, imenovana kodon, kodira eno od 20 osnovnih aminokislin. Ker je dedna informacija v DNA zapisana kot kombi¬ nacija štirih različnih nukleotidov (G, A, C in T), je vseh možnih kombinacij nukleotidov v kodonih 64 (4 x 4 x 4). Omenjenih 64 tripletov nukleotidov tvori genski kod (sl. 6.4). Genski kod je univerzalen, saj je pomen posameznih kodonov praktično enak pri vseh organizmih. Genski kod je tudi degeneriran, saj veliko ve¬ čino aminokislin kodira več različnih kodonov. V kodonu sta tako za kodiranje aminokisline ključna prva dva nukleotida, tretji pa je v okviru kodonov, ki kodirajo isto aminokislino lahko različen in ga zato imenujemo opotekavi nukleotid. Trije kodoni v kodu ne kodirajo aminokislin. Pravimo, da so nesmiselni ali stop-kodoni in določajo konec polipeptidne verige. Slika 6.4: Genski kod. Tripleti nukleozidov v mRNA (U: uridin, A: adenozin, C: citidin, G: gvanidin) kodirajo sledeče aminoki¬ sline: Phe: fenilalanin, Leu: leucin, Ile: izoleucin, Met: metio- nin, Val: valin, Ser: serin, Pro: prolin, Thr: treonin, Ala: alanin, Tyr: tirozin, His: histidin, Gnl: glutamin.Asn: asparagin, Lys: lizin, Asp: asparaginska kislina, Glu: glutaminska kislina, Cys: cistein, Trp: triptofan, Arg: arginin, Gly: glicin, t.k.: stop kodo¬ ni (Štrus, Splošna zoologija 1999) Ker so aminokisline kodirane s tremi nukleotidi, je lahko zapo¬ redje nukleotidov v mRNA prebrano v treh bralnih okvirjih. Tako lahko posamezna mRNA kodira tri različna zaporedja aminoki¬ slin, odvisno od začetka branja, pri čemer je za sintezo končnega proteina pravilno le eno. Začetek branja nukleotidnih tripletov je kombinacija nukleotidov AUG ali start-kodon (AUG), ki pri evkari- ontih sicer kodira aminokislino metionin. 81 Zaporedje aminokislin v proteinih določa DNA, za sintezo pro¬ teinov pa je potrebno posredovanje ribonukleinskih kislin (RNA), ki so iz ribonukleotidov, sestavljenih iz riboze in uracila, ki nado¬ mešča timin. Tudi v RNA so nukleotidi povezani s 5’-3’ fosfodiestr- sko vezjo. RNA se ne ureja v dvojno vijačnico, temveč je pravilo¬ ma v obliki enojne verige. Zaradi povezovanja krajših homolognih delov iste RNA molekule se pogosto lahko oblikujejo zanke in druge sekundarne strukture. Poznanih je več tipov RNA, ki imajo v celici različne vloge. Informacijska ali mRNA je prepis nukleo- tidnega zaporedja gena z DNA in informacija za prevod genskega zapisa v protein, ki poteka na ribosomih. Molekula mRNA je različ¬ no dolga in pogosto povezana s proteini. Ribosomska ali rRNA s proteini tvori ribosomski podenoti, v katerih ima poleg strukturne tudi encimsko funkcijo pri sintezi proteinov. Prenašalna ali tRNA je iz 70 do 90 nukleotidov in ima posebno obliko iz štirih zank, z nekomplementarnimi bazami in pet predelov, kjer se komple¬ mentarne baze med seboj povezujejo (sl. 6.5). Pomembna je za prenos ustreznih aminokislin do mesta prevajanja na ribosomih. Aminokislina se veže na 3’ terminalni del, druga zanka pa vsebuje baze, ki tvorijo antikodon, ki se med sintezo beljakovin poveže s kodonom mRNA. V različnih stopnjah proteinske sinteze sode¬ lujejo tudi krajše molekule RNA, ki so z beljakovinami vezane v ribocime, ribonukleinske komplekse z encimskimi lastnostmi. Ti na primer omogočajo prehod polipeptidov v endoplazemski reti- kulum, sodelujejo pri izrezovanju intronov ob procesiranju mRNA in kemičnih modifikacijah rRNA. ANTIKODON OPOTEKAVI^ NUKLEOTID /G A m ^T-p s G C ' c 'y^ a C i C I A 3 ' Slika 6.5: Zgradba prenašalne RNA (mRNA): a) shema sekun¬ darne zgradbe s štirimi ročicami, ki so urejene v obliki dvojne vijačnice, in štirimi zankami, kjer je molekula enovijačna (A: adenin, C: citozin, P: psevdouridin, R: purinska baza, T: riboti- midin, V: spremenjen purin, Y: pirimidin); b) tridimenzionalni model tRNA (Štrus, Splošna zoologija, 1999) Mehanizem izražanja ali ekspresije genske informacije je se¬ stavljen proces, v katerem se genska informacija kodirajoče verige 82 DNA najprej prepiše v mRNA, ki informacijo prenese do riboso- mov v citoplazmi, kjer se ob sodelovanju tRNA prevede v amino¬ kislinsko zaporedje. Proces prepisa ali transkripcije nukleotidnega zaporedja iz DNA v mRNA katalizira encimski kompleks, imenovan polimera- za RNA, ki ga sestavlja šest podenot. Ta se veže na zaporedje DNA tik pred strukturnim genom, imenovano promotor, kjer odvije dvojno vijačnico DNA in razklene obe verigi DNA (sl. 6.6). Polime- raza RNA se usede na matrično verigo, po kateri se pomika v smeri od 3’ proti 5’ koncu. Ob tem katalizira sintezo 5’-3’-fosfodiestrskih vezi med nukleotidi in nastanek komplementarne verige mRNA z nasprotno polarnostjo (5’-3’). Ob drsenju vzdolž DNA polimeraza RNA sproti odvija dvojno vijačnico in razpira obe verigi, ki se za njo ponovno povezujeta in zavijata v dvojno vijačnico. Ko poli¬ meraza doseže zaporedje nukleotidov na koncu gena, imenovano terminator, se loči od DNA in tako konča prepisovanje. Še zadnji nepovezani komplementarni nukleotidi DNA se povežejo in tvori¬ jo dvojno vijačnico. 5 ' Slika 6.6: Transkripcija DNA v mRNA (Štrus, Splošna zoologi¬ ja, 1999) Mehanizem prepisovanja mRNA je univerzalen za vse organiz¬ me, kljub temu pa obstajajo nekatere razlike med prepisovanjem prokariontske in evkariontske mRNA (sl. 6.7). Pri prokariontih se nukleoid nahaja v citoplazmi, zato se lahko ribosomi vežejo neposredno na novonastajajočo verigo mRNA ter prično s preva¬ janjem v aminokislinsko zaporedje. Evkarionti imajo tri različne tipe RNA polimeraze. Prepis večine rRNA katalizira polimeraza I, polimeraza II katalizira prepis strukturnih genov in RNA nekaterih ribocimov, medtem ko polimeraza III prepisuje tRNA. Poleg tega se pri evkariontih primarno prepisana ali prekurzorska mRNA v jedru pred prenosom v citoplazmo še predela oziroma procesira. Primarnemu prepisu mRNA se na 5’ koncu doda metilgvanozin, imenovan kapa (ang. »cap«), na 3’ koncu pa zaporedje od 100 do 200 adeninskih nukleotidov, imenovano rep (ang. »poIy-A tail«). Iz prekurzorske mRNA se izrežejo tudi nekodirajoči introni, kodira¬ joči eksoni pa se s pomočjo ribocima snRNP povežejo v zrelo ali funkcionalno mRNA, ki zapusti jedro. 83 (A) EVKARIONTI Slika 6.7: Primerjava proteinske sineze v evkariontski in pro- kariontski celici (povzeto po Alberts et al., Molecular Biology of the Celi, 2002) Prevajanje ali translacija je proces dekodiranja nukleotid- nega zaporedja mRNA v aminokislinska zaporedja. Poteka na ri- bosomih, v procesu sodelujejo še mRNA, tRNA in številni encimi. Ribosomi so ribonukleoproteinski kompleksi iz rRNA, encimov in strukturnih proteinov, ki oblikujejo dve podenoti (sl. 6.8). Ribo¬ somi prokariontov so velikosti 70 S, ribosomi evkariontov pa so nekoliko večji in so 80 S (S = enota hitrosti usedanja pri ultracen- trifugiranju). Večjo podenoto ribosoma prokariontov (50 S) sesta¬ vljata molekuli 5 S in 23 S rRNA ter 34 proteinov, manjšo (30 S) pa 16 S rRNA in 21 proteinov. Pri evkariontih je večja podenota (60 S) sestavljena iz 5 S, 5,8 S in 28 S rRNA ter 49 proteinov, manjša (40S) pa iz 18 S rRNA in 33 proteinov. 84 RIBOSOMI PROKARIONTOV / 1500 nukleotidov nukleotidov -21 PROTEINOV RIBOSOMI EVKARIONTOV \ 18S RNK 2000 nukleotidov v -33 PROTEINOV 5,SS RNK 1SS RNK 6S RNK 5000 nukleotidov V -45 PROTEINOV Slika 6.8: Zgradba ribosomov prokariontov (70S) in evkarion- tov (80S) (Štrus, Splošna zoologija, 1999) Prenašalna ali tRNA prenaša aminokisline do ribosoma. Na srednji zanki ima antikodon, zaporedje treh baz, ki so komple¬ mentarne zaporedju kodona na mRNA. Pred vezavo na 3’ konec tRNA aminokisline aktivira encim aminoacil tRNA sintetaza ob prisotnosti ATP, nastala struktura pa se imenuje aminoacil-tRNA. V ribosomu sta dve vezavni mesti za tRNA, A in P. Na mesto A (aminoacil mesto) se pritrjujejo ustrezne aminoacil-tRNA, na me¬ stu P (peptidil mesto) pa je tRNA z vezanim rastočim zaporedjem aminokislin. Prva stopnja translacije je iniciacija (sl. 6.9). Ta se prične z nastankom iniciacijskega kompleksa, ki ga tvorijo manjša ribo- somska podenota, posebni proteini (iniciacijski faktorji), mRNA in iniciacijska tRNA. Ta je vezana na mesto P manjše podenote ribosoma, medtem ko je mesto A v tej fazi še nezasedeno. Inici¬ acijska tRNA pri evkariontih prenaša aminokislino metionin, pri prokariontih pa formilmetionin. Obe se v kasnejših fazah sinteze peptidov encimsko odstranita. Nastali kompleks se veže na 5’ ko¬ nec mRNA tako, da rRNA manjše podenote prepozna komplemen¬ tarna mesta na mRNA. Omenjeni kompleks nato drsi proti 3’ koncu mRNA, dokler antikodon iniciacijske tRNA ne prepozna start ko¬ dona (AUG) na mRNA. Ob vezavi kodona in antikodona se komple¬ ksu priključi še večja ribosomska podenota in iniciacijska faza se s tem zaključi. 85 RIBOSOM Slika 6.9: Translacija: a) ribosom z mestoma P (peptidil) in A (aminoacil), manjša podenota je povezana z mRNA; b) prva aminoacil-tRNA je na mestu P, druga molekula prihaja na me¬ sto A; c) povezava aminokislin s peptidno vezjo; d) sprostitev prve tRNA z mesta P; e) druga aminoacil-tRNA se prenese na mesto P (Štrus, Splošna zoologija, 1999) Translacija se nadaljuje kot elongacija, pri kateri se ribosom pomika proti 3’ koncu mRNA tako, da se na mesto A ribosoma do¬ dajajo nove tRNA z antikodoni, ki ustrezajo zaporedju na mRNA. Vezavo aminokisline na mestu A z aminokislino na mestu P ka- talizira encim peptidil transferaza, ki je večja RNA molekula (ri- bocim) velike ribosomske podenote. Pri procesu sodelujejo tudi proteini, imenovani elongacijski faktorji, energijo pa zagotavlja GTP. Ob tem se tRNA z mesta P sprosti, ribosom pa se pomakne vzdolž mRNA za en kodon tako, da se tRNA z vezano peptidno verigo prenese z mesta A na mesto P. Sproščeno mesto A pa zase¬ de naslednja tRNA z ustreznim antikodonom. Elongacija poteka, dokler do mesta A ne pride stop-kodon (UAA, UAG, UGA), ki ustavi podaljševanje peptidne verige. Proces uravnavajo proteini, imeno¬ vani terminacijski faktorji, ki se vežejo neposredno na stop-kodon in spremenijo delovanje peptidil transferaze. Ob tem se peptidna veriga sprosti z zadnje aminoacil tRNA na mestu P. Sprosti se tudi mRNA in ribosom ponovno razpade na podenoti. Tako pri prokariontih kot pri evkariontih je sinteza aminoki¬ slinskih zaporedij pospešena tako, da po isti mRNA hkrati drsi več ribosomov. Ti oblikujejo strukturo, imenovano polisom. Hitrost sinteze proteinov je pri evkariontih približno 2 aminokislini na sekundo, pri prokariontih pa je ta hitrost tudi do desetkrat večja. 86 KAJ JE NOVEGA BRUCKI? Na primeru bioluminiscence, ki jo povzroča bakterija Vi- brio fischeri, ki se naseli v svetlobnih organih lignja, ra¬ zloži regulacijo prepisovanja gena za encim luciferazo. Razišči katalitsko vlogo molekul RNA. 6.3 REGULACIJA SINTEZE BELJAKOVIN V vseh celicah večceličnega organizma je enak genom. Kljub temu se celice med seboj zelo razlikujejo, kar je posledica regu¬ lacije izražanja genov. Ta zagotavlja, da celice prevedejo le tisti del dedne informacije, ki ga v danem trenutku potrebujejo, velika večina genoma pa zaradi prihranka energije ostaja neizražena. Izražanje genov pri evkariontih je lahko regulirano na več nivojih. Tako lahko regulacija poteka v fazi transkripcije mRNA, procesiranja mRNA in njenega transporta v citoplazmo, transla¬ cije, razgradnje mRNA ali dokončnega oblikovanja proteinov in njihove aktivnosti. Proces ekspresije genov je na podoben način nadzorovan tudi pri prokariontih. Zaradi manjšega genoma in števila proteinov, ki jih kodira, so mehanizmi regulacije genske ekspresije, zlasti na nivoju tran¬ skripcije mRNA, najbolje preučeni pri bakterijah. Pri prokariontih so geni z informacijami za encime ali druge proteine, ki sodelu¬ jejo pri posameznem presnovnem procesu običajno skupaj, v isti transkripcijski enoti - operonu. Vsa skupina genov določene me- tabolne poti se zato praviloma prepiše v eno mRNA in informacije se v enakem vrstnem redu, kot potekajo v metabolni poti, tudi prevajajo. Prepisovanje skupine genov operona se začne nekoliko pred prvim strukturnim genom v predelu DNA, kjer sta promotor in operator. Promotorska regija je mesto DNA, kamor se veže po- limeraza RNA. Med njo in prvim strukturnim genom leži operator, kamor se veže regulacijski protein (efektor), ki sproži (aktivator) ali zavre (represor) prepisovanje RNA strukturnih genov. Izražanje strukturnih genov je nadzorovano z vplivom na ak¬ tivnost efektorja in njegovo vezavo na operator. V primeru ne¬ gativne regulacije vezava represorja prepreči/prekine prepis mRNA. V primeru pozitivne regulacije vezava regulacijskih pro¬ teinov na del DNA pred promotorjem omogoča vezavo polimeraze RNA in s tem začetek prepisa mRNA (sl. 6.10). 87