Oznaka poročila: ARRS-RPROJ-ZP-2010-1/193 ZAKLJUČNO POROČILO O REZULTATIH RAZISKOVALNEGA PROJEKTA A. PODATKI O RAZISKOVALNEM PROJEKTU 1. Osnovni podatki o raziskovalnem projektu Šifra projekta Jl-9804 Naslov projekta Računalniške simulacije in analiza kolektivnih gibanj biomolekul Vodja projekta 13627 Franci Merzel Tip projekta J Temeljni projekt Obseg raziskovalnih ur 2.835 Cenovni razred D Trajanje projekta 01.2007 - 12.2009 Nosilna raziskovalna organizacija 104 Kemijski inštitut Raziskovalne organizacije - soizvajalke Družbeno- ekonomski cilj 13. Splošni napredek znanja - RiR financiran iz drugih virov (ne iz splošnih univerzitetnih fondov - SUF) 2. Sofinancerji1 1. Naziv Naslov 2. Naziv Naslov 3. Naziv Naslov B. REZULTATI IN DOSEŽKI RAZISKOVALNEGA PROJEKTA 3. Poročilo o realizaciji programa raziskovalnega projekta2 V okviru raziskovalnega projekta smo razvili metodo in pripadajoči programski paket "NMscatt" za računanje spektrov neelastičnega nevtronskega sipanja biomolekul na podlagi klasičnih simulacij, ki smo jo objavili v reviji Computer Physics Communications. Metoda je služila najprej kot osnovno orodje pri študiju razpiranja baznih parov pri molekuli DNK. Rezultate študije smo objavili v reviji Physical Review E, kjer smo pokazali, da lahko z uporabljenim atomskim modelom DNK s potencialnim poljem sil Charmm zelo dobro reproduciramo izmerjeno disperzijsko zvezo za valovanje vzdolž vijačne osi DNK molekule. Ugotovili smo, da vibracijski načini, ki ustrezajo razpiranju vlaken DNK in so podobni "dihanju", niso lokalizirani na posamezne frekvence, temveč da obstaja zvezno območje (pas) vibracijskih stanj, 50-300 cm-1 s takšnim značajem. Omenjene raziskave smo opravili v sodelovanju s partnerji iz tujine (prof. Mark R. Johnson, Institut Laue Langevin, Grenoble, Francija) tudi s pomočjo bilateralnega projekta "Proteus". S pomočjo programskega paketa "NMscatt" smo s sodelavci iz Univerze Heidelberg (dr. Lars Meinhold in prof. Jeremy C. Smith) študirali tudi mrežna nihanja kristaliziranega proteina ribonukleaze. Pokazali smo, da je glavni prispevek k razširitvi Braggovih črt (zaradi t.i. difuznega sipanja) na račun akustičnih fononov. Rezultate smo objavili v reviji Physical Review Letters. Pri študiju molekularnih nihanj kolagena smo poleg metod, ki uporabljajo parametrizirana polja sil, uporabili tudi metode teorije gostotnih funkcionalov. Ugotovili smo, da se med tvorbo sekundarne in terciarne strukture kolagena najbolj signifikantno spreminjajo nihajni načini v območju amidnega V pasu na glicinu, ki ustrezajo frekvenčnemu območju 575-750cm-1. Rezultete smo objavili v reviji Chemical Physics. Pri razvoju metode za simulacije dinamike konfiguracijskih sprememb biomolekulskih smo optimizirali parametre za simulacijo dimerov amiloidnega beta peptida, ki v primeru tvorbe amiloidnih plakov povzroča Alzheimerjevo bolezen. Metoda temelji na kontroliranem vzbujanju tistih načinov gibanj, ki povzročajo največje strukturne spremembe v sistemu. Rezultati so zbrani v rokopisu z naslovom "Probing solvent ionic strength effects on amyloid beta fibril using molecular dynamics simulations". 4. Ocena stopnje realizacije zastavljenih raziskovalnih ciljev-3 Delo v okviru projekta je potekalo v skladu z zastavljenim programom dela. Rezultati potrjujejo pravilnost izhodiščne hipoteze, namreč da je s klasičnimi atomskimi modeli in parametrizacijami polja sil mogoče reproducirati merljive količine v zvezi z dinamiko biomolekul, ki jih posredujejo eksperimenti s sipanjem nevtronov in žarkov X. To dejstvo smo uporabili pri interpretaciji nizkofrekvenčnih nihanj molekule DNA, mrežne dinamike proteinskega kristala ribonukleoza A, encima dihidrofolat-reduktaze in kolagena. Prav tako smo uspeli pokazati, da je mogoče doseči bistvene pohitritve pri simulacijah konformacijskih sprememb, če kontrolirano vzbujamo vibracijske načine gibanja vzdolž izbranih glavnih komonent (principal component analysis), kar je v zvezi z drugim zastavljenim ciljem omenjenega projekta. 5. Utemeljitev morebitnih sprememb programa raziskovalnega projekta4 Do spremeb izvajanja projekta ni prišlo. 6. Najpomembnejši znanstveni rezultati projektne skupine5 Znanstveni rezultat 1. Naslov SLO NMscatt : program za računanje neelastičnega sipanja na velikih biomolekularnih sistemih z uporabo simulacij s klasičnimi polji sil. ANG NMscatt : a program for calculating inelastic scattering from large biomolecular systems using classical force-field simulations. Opis SLO MERZEL, Franci, FONTAINE-VIVE, Fabien, JOHNSON, Mark R. V članku podamo opis izpeljave metode in programskega paketa, ki sestoji iz več modulov. MERZEL, Franci, FONTAINE-VIVE, Fabien, JOHNSON, Mark R. ANG We provide description of the method and of the program package consisting of several different modules. Objavljeno v Comput. phys. commun.. [Print ed.], 2007, vol. 177, no. 6, str. 530-538. Tipologija 1.01 Izvirni znanstveni članek COBISS.SI-ID 3754266 2. Naslov SLO Mrežna dinamika proteinskega kristala. ANG Lattice dynamics of a protein crystal. MEINHOLD, Lars, MERZEL, Franci, SMITH, Jeremy C, Opis SLO Članek o prispevku difuznega sipanja na razširitev Braggovih črt zaradi mrežnih nihanjih v proteinskih kristalih na podlagi atomskih simulacij. Objava v reviji z visokim faktorjem vpliva IF=7.07. MEINHOLD, Lars, MERZEL, Franci, SMITH, Jeremy C, ANG We discuss the contribution of the diffuse scattering due to lattice vibrations (phonons) to the broadening of the Bragg peaks in protein crystal based on all-atom simulations. Objavljeno v Phys. rev. lett., 2007, vol. 99, no. 9, 138101-1-138101-4 Tipologija 1.01 Izvirni znanstveni članek COBISS.SI-ID 3794714 3. Naslov SLO Atomistični model DNA: fononi in razpiranje baznih parov ANG Atomistic model of DNA : phonons and base-bair opening MERZEL, Franci, FONTAINE-VIVE, Fabien, JOHNSON, Mark R., KEARLY, Gordon J. Opis SLO V članku interpretiramo nizkofrekvenčna nihanja molekule DNK ter razložimo izvor disperzije za valovanje vzdolž vijačnice. Članek je bil izbran kot posebno aktualen članek v Virtual Journal of Biological Physics Research (ISSN 1553-9628, published by the American Institute of Physics and the American Physical Society. MERZEL, Franci, FONTAINE-VIVE, Fabien, JOHNSON, Mark R., KEARLY, Gordon J. ANG We provide interpretation of low-frequency vibrations of DNA molecule and explain the origin of dispersion for a wave propagating along the helical axis. The paper was selected as a topical article of Virtual Journal of Biological Physics Research (ISSN 1553-9628, published by the American Institute of Physics and the American Physical Society. Objavljeno v Phys. rev., E Stat. nonlinear soft matter phys. (Print), 2007, vol. 76, no. 3, str. 031917-1-031917-5. Tipologija 1.01 Izvirni znanstveni članek COBISS.SI-ID 3791130 4. Naslov SLO Kolagen in sestavni polipeptidi: nizkofrekvenčne in amidne vibracije. ANG Collagen and component polypeptides : low frequency and amide vibrations. FONTAINE-VIVE, Fabien, MERZEL, Franci, JOHNSON, Mark R., KEARLY, Gordon J. Opis SLO Pri študiju molekularnih nihanj kolagena smo ugotovili, da se med tvorbo sekundarne in terciarne strukture kolagena najbolj signifikantno spreminjajo nihajni načini v območju amidnega V pasu na glicinu, ki ustrezajo frekvenčnemu območju 575-750cm-1. FONTAINE-VIVE, Fabien, MERZEL, Franci, JOHNSON, Mark R., KEARLY, Gordon J. ANG Studying molecular vibrations of collagen we found out that the vibrational modes of the amide V band corresponding to the frequency range 575- 750cm-1 undergo the most significant changes during the formation of secondary and tertiary structure of collagen. Objavljeno v Chem. phys.. [Print ed.], 2009, vol. 355, issue 2/3, str. 141-148 Tipologija 1.01 Izvirni znanstveni članek COBISS.SI-ID 4069658 5. Naslov SLO Tvorba tekoče urejene faze v holesterono sfingomielinskem dvosloju: uporaba vseatomske molekularne dinamike ANG Liquid-ordered phase formation in cholesterol/sphingomyelin bilayers : all- atom molecular dynamics simulations. ZIDAR, Jernej, MERZEL, Franci, HODOSČEK, Milan, REBOLJ, Katja, SEPČIC, Kristina, MAČEK, Peter, JANEŽIČ, Dušanka. Opis SLO Studij strukturnih in dinamičnih sprememb znotraj holesterolno sfingomileinskega dvosloja, ki nakažejo fazni prehod med tekočo neurejeno fazo in tekočo urejeno fazo. ZIDAR, Jernej, MERZEL, Franci, HODOSČEK, Milan, REBOLJ, Katja, SEPČIC, Kristina, MAČEK, Peter, JANEŽIČ, Dušanka. ANG Here we study structural and dynamical changes within cholesterol- sphingomyelin bilayers indicating the phase transition between liquid disordered and liquid ordered phase. Objavljeno v J. phys. chem., B Condens. mater. surf. interfaces biophys., 2009, vol. 113, no. 48, str. 15795-15802. Tipologija 1.01 Izvirni znanstveni članek COBISS.SI-ID 4303642 7. Najpomembnejši družbeno-ekonomsko relevantni rezultati projektne skupine6 Družbeno-ekonomsko relevantni rezultat 1. Naslov SLO MERZEL, Franci, JOHNSON, Mark R. Atomistični model DNA : nizkofrekvenčna nihanja in razpiranje baznih parov. ANG MERZEL, Franci, JOHNSON, Mark R. An atomistic model of DNA : low frequency vibrations and base-pair opening . Opis SLO Vabljeno predavanje o nizkofrekvenčnih nihanjih DNA molekule. ANG Invited talk on low frequency vibrations of DNA. Sifra B.04 Vabljeno predavanje Objavljeno v ZIMÄNYI, Laszlo (ur.), KOTA, Zoltan (ur.), SZALONTAI, Balazs (ur.). RBC 2007, Regional Biophysical Conference, 21-25 August 2007, Balatonfüred, Hungary. Book of abstracts. [S. l.]: Hungarian Biophysical Society, 2007, str. 61. Tipologija 1.12 Objavljeni povzetek znanstvenega prispevka na konferenci COBISS.SI-ID 3779610 2. Naslov SLO MERZEL, Franci, JOHNSON, Mark R. Načini mrežnih nihanj DNA molekule: atomistične simulacije in neelastično nevtronsko sipanje ANG MERZEL, Franci, JOHNSON, Mark R. Lattice vibrational modes of DNA : atomic detail simulations versus inelastic neutron scattering Opis SLO Prikaz možnosti računanja sipalnih opazljivk DNA molekule iz atomističnih modelov. ANG Discussing the possibility of calculating scattering observables of DNA from atomistic models. Sifra B.04 Vabljeno predavanje Objavljeno v Dynamics of molecules and materials : book of abstracts. [S.l.: s. n.], 2007, str. 14. Tipologija 1.12 Objavljeni povzetek znanstvenega prispevka na konferenci COBISS.SI-ID 3755034 3. Naslov SLO MERZEL, Franci. Nizkofrekvenčne vibracije in razpiranje baznih parov pri DNK molekuli ANG MERZEL, Franci. Low frequency vibrations and base-pair opening of DNA Opis SLO Prikaz uporabe računskih oredij za razlago vibracijskih načinov pri DNK. ANG Demonstration of application of different computational tools for interpratation of vibrational modes of DNA. Šifra B.04 Vabljeno predavanje Objavljeno v BABIC, Darko (ur.). The 2nd Opatija meeting on computational solutions in the life sciences, Opatija, 4-9 September 2007 : book of abstracts. Zagreb: Ruđer Bošković Institute, 2007, str. 28. Tipologija 1.12 Objavljeni povzetek znanstvenega prispevka na konferenci COBISS.SI-ID 3775514 4. Naslov SLO MERZEL, Franci. Interpretacija nizkofrekvenčnih nihanj biomolekul. ANG MERZEL, Franci. Interpretation of low-frequency vibrations of biomolecules. Opis SLO Prikaz uporabe računskih oredij za razlago vibracijskih načinov pri biomolekulah. ANG Demonstration of application of different computational tools for interpratation of vibrational modes of biomolecules. Šifra B.04 Vabljeno predavanje Objavljeno v Institut Jožef Stefan, Laboratorij za biofiziko (EPR center Ljubljana), 13. jan. 2009. Tipologija 3.14 Predavanje na tuji univerzi COBISS.SI-ID 4143386 5. Naslov SLO Obisk Laboratorija za molekularno modeliranje ANG Visiting Laboratory for molecular modeling Opis SLO JANEŽIČ, Dušanka, HODOŠČEK, Milan, PRAPROTNIK, Matej, KONC, Janez, MERZEL, Franci. ANG JANEŽIČ, Dušanka, HODOŠČEK, Milan, PRAPROTNIK, Matej, KONC, Janez, MERZEL, Franci. Šifra E.03 Drugo Objavljeno v Pogledi na sodobno znanost. Ljubljana: Radio Slovenija 3, 2. feb. 2009. Tipologija 3.11 Radijski ali TV dogodek COBISS.SI-ID 4085274 8. Drugi pomembni rezultati projetne skupine7 V okviru izvajanja projekta je bilo iuspešno zaključeno doktorsko usposabljanje mladega raziskovalca Jerneja Zidarja pod mentorstvom dr. Francija Merzela. 9. Pomen raziskovalnih rezultatov projektne skupine8 9.1. Pomen za razvoj znanosti9 SLO Razvite računske metode predstavljajo nove učinkovite rešitve problemov na področju simulacij biomolekularnih sistemov. Metode vključujemo v obstoječe programske pakete, s čimer ponujamo nove možnosti obravnave dinamskih lastnosti biomolekul širšemu krogu raziskovalcev. Razvite metode predstavljajo prispevek k izboljšanju napovedne moči računalniških simulacij biomolekularnih sistemov. ANG The developed methods present new efficient solutions of problems in the field of biomolecular simulations. The methods are built-in into existing simulation program packages, providing the availability of the moetgods to the wider range of researchers. Our methods present contribution to in improving the prediction power of biomolecular simulations. 9.2. Pomen za razvoj Slovenije10 SLO V okviru projekta sodelujemo z vodilnimi raziskovalnimi inštitucijami na področju, kot sta inštitut ILL v Grenoblu in Univerza Heidelberg, s čimer utrjujemo naše mednarodne povezave. Poleg tega imamo slovenski raziskovalci možnost dostopa do instrumentov za nevtronsko sipanje na ILL v Grenoblu. Metode, ki jih razvijamo, so na voljo uporabnikom, med njimi tudi študentom doktorkega študija različnih naravoslovnih usmeritev. ANG_ Within the project we collaborate with the leading institutions in the field, like institute ILL in Grenoble and University of Heidelberg, which strengthens our international connections. Besides, we get a chance to access the instruments for neutron scattering in ILL. The developed methods are made available to the users, in particular to Phd studens studying at different natural-science faculties. 10. Samo za aplikativne projekte! Označite, katerega od navedenih ciljev ste si zastavili pri aplikativnem projektu, katere konkretne rezultate ste dosegli in v kakšni meri so doseženi rezultati uporabljeni Cilj F.01 Pridobitev novih praktičnih znanj, informacij in veščin Zastavljen cilj Oda One Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.02 Pridobitev novih znanstvenih spoznanj Zastavljen cilj DA NE Rezultat 6 Uporaba rezultatov 1 6 F.03 Večja usposobljenost raziskovalno-razvojnega osebja Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 j Uporaba rezultatov 1 6 F.04 Dvig tehnološke ravni Zastavljen cilj Oda One Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.05 Sposobnost za začetek novega tehnološkega razvoja Zastavljen cilj DA NE Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.06 Razvoj novega izdelka Zastavljen cilj O DA J NE Rezultat 1 JL Uporaba rezultatov 1 6 F.07 Izboljšanje obstoječega izdelka Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 ^ Uporaba rezultatov 6 F.08 Razvoj in izdelava prototipa Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 6 Uporaba rezultatov 6 F.09 Razvoj novega tehnološkega procesa oz. tehnologije Zastavljen cilj da One Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.10 Izboljšanje obstoječega tehnološkega procesa oz. tehnologije Zastavljen cilj DA NE Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.11 Razvoj nove storitve Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 6 Uporaba rezultatov 1 6 F.12 Izboljšanje obstoječe storitve Zastavljen cilj DA J NE Rezultat 1 6 Uporaba rezultatov 6 F.13 Razvoj novih proizvodnih metod in instrumentov oz. proizvodnih procesov Zastavljen cilj DA NE Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.14 Izboljšanje obstoječih proizvodnih metod in instrumentov oz. proizvodnih procesov Zastavljen cilj da One Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.15 Razvoj novega informacijskega sistema/podatkovnih baz Zastavljen cilj DA NE Rezultat 6 Uporaba rezultatov 1 6 F.16 Izboljšanje obstoječega informacijskega sistema/podatkovnih baz Zastavljen cilj DA J NE Rezultat 1 6 Uporaba rezultatov 1 6 F.17 Prenos obstoječih tehnologij, znanj, metod in postopkov v prakso Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 6 Uporaba rezultatov 6 F.18 Posredovanje novih znanj neposrednim uporabnikom (seminarji, forumi, konference) Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 6 Uporaba rezultatov 1 6 F.19 Znanje, ki vodi k ustanovitvi novega podjetja ("spin off") Zastavljen cilj DA J NE Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.20 Ustanovitev novega podjetja ("spin off") Zastavljen cilj DA NE Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.21 Razvoj novih zdravstvenih/diagnostičnih metod/postopkov Zastavljen cilj DA J NE Rezultat 1 6 Uporaba rezultatov 1 6 F.22 Izboljšanje obstoječih zdravstvenih/diagnostičnih metod/postopkov Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 6 Uporaba rezultatov 6 F.23 Razvoj novih sistemskih, normativnih, programskih in metodoloških rešitev Zastavljen cilj da One Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.24 Izboljšanje obstoječih sistemskih, normativnih, programskih in metodoloških rešitev Zastavljen cilj DA NE Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.25 Razvoj novih organizacijskih in upravljavskih rešitev Zastavljen cilj da One Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.26 Izboljšanje obstoječih organizacijskih in upravljavskih rešitev Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 6 Uporaba rezultatov 1 6 F.27 Prispevek k ohranjanju/varovanje naravne in kulturne dediščine Zastavljen cilj DA NE Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.28 Priprava/organizacija razstave Zastavljen cilj Oda One Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.29 Prispevek k razvoju nacionalne kulturne identitete Zastavljen cilj Oda ne Rezultat I d Uporaba rezultatov 1 6 F.30 Strokovna ocena stanja Zastavljen cilj DA NE Rezultat 1 d Uporaba rezultatov 6 F.31 Razvoj standardov Zastavljen cilj Oda One Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.32 Mednarodni patent Zastavljen cilj DA NE Rezultat 6 Uporaba rezultatov 1 6 F.33 Patent v Sloveniji Zastavljen cilj oJ DA J NE Rezultat 1 d Uporaba rezultatov 6 F.34 Svetovalna dejavnost Zastavljen cilj DA NE Rezultat 6 Uporaba rezultatov 6 F.35 Drugo Zastavljen cilj Oda One Rezultat Uporaba rezultatov 1 6 Komentar 11. Samo za aplikativne projekte! Označite potencialne vplive oziroma učinke vaših rezultatov na navedena področja Vpliv Ni vpliva Majhen vpliv Srednji vpliv Velik vpliv G.01 Razvoj visoko-šolskega izobraževanja G.01.01. Razvoj dodiplomskega izobraževanja O o o o G.01.02. Razvoj podiplomskega izobraževanja o o o o G.01.03. Drugo: o o o o G.02 Gospodarski razvoj G.02.01 Razširitev ponudbe novih izdelkov/storitev na trgu O O O O G.02.02. Širitev obstoječih trgov o o o o G.02.03. Znižanje stroškov proizvodnje o o o o G.02.04. Zmanjšanje porabe materialov in energije O O O O G.02.05. Razširitev področja dejavnosti o o o o G.02.06. Večja konkurenčna sposobnost o o o o G.02.07. Večji delež izvoza o o o o G.02.08. Povečanje dobička o o o o G.02.09. Nova delovna mesta o o o o G.02.10. Dvig izobrazbene strukture zaposlenih O O O O G.02.11. Nov investicijski zagon o o o o G.02.12. Drugo: o o o o G.03 Tehnološki razvoj G.03.01. Tehnološka razširitev/posodobitev dejavnosti O O O O G.03.02. Tehnološko prestrukturiranje dejavnosti O O O O G.03.03. Uvajanje novih tehnologij o o o o G.03.04. Drugo: o o o o G.04 Družbeni razvoj G.04.01 Dvig kvalitete življenja o o o o G.04.02. Izboljšanje vodenja in upravljanja o o o o G.04.03. Izboljšanje delovanja administracije in javne uprave O O O O G.04.04. Razvoj socialnih dejavnosti o o o o G.04.05. Razvoj civilne družbe o o o o G.04.06. Drugo: o o o o G.05. Ohranjanje in razvoj nacionalne naravne in kulturne dediščine in identitete O O O O G.06. Varovanje okolja in trajnostni razvoj O o o o G.07 Razvoj družbene infrastrukture G.07.01. Informacijsko-komunikacijska infrastruktura O O O O G.07.02. Prometna infrastruktura o o o o G.07.03. Energetska infrastruktura o o o o G.07.04. Drugo: o o o o G.08. Varovanje zdravja in razvoj zdravstvenega varstva O O O O G.09. Drugo: o o o o Komentar 12. Pomen raziskovanja za sofinancerje, navedene v 2. točki11 1. Sofinancer Vrednost sofinanciranja za celotno obdobje trajanja projekta je znašala: EUR Odstotek od utemeljenih stroškov projekta: % Najpomembnejši rezultati raziskovanja za sofinancerja Šifra 1. 2. 3. 4. 5. Komentar Ocena 2. Sofinancer Vrednost sofinanciranja za celotno obdobje trajanja projekta je znašala: EUR Odstotek od utemeljenih stroškov projekta: % Najpomembnejši rezultati raziskovanja za sofinancerja Šifra 1. 2. 3. 4. 5. Komentar Ocena 3. Sofinancer Vrednost sofinanciranja za celotno obdobje trajanja projekta je znašala: EUR Odstotek od utemeljenih stroškov projekta: % Najpomembnejši rezultati raziskovanja za sofinancerja Sifra 2. 1 3. 4. 5. Komentar Ocena C. IZJAVE Podpisani izjavljam/o, da: • so vsi podatki, ki jih navajamo v poročilu, resnični in točni • se strinjamo z obdelavo podatkov v skladu z zakonodajo o varstvu osebnih podatkov za potrebe ocenjevanja, za objavo 6., 7. in 8. točke na spletni strani http://sicris.izum.si/ ter obdelavo teh podatkov za evidence ARRS • so vsi podatki v obrazcu v elektronski obliki identični podatkom v obrazcu v pisni obliki • so z vsebino zaključnega poročila seznanjeni in se strinjajo vsi soizvajalci projekta Podpisi: Franci Merzel in podpis vodje raziskovalnega projekta zastopnik oz. pooblaščena oseba RO Kraj in datum: Ljubljana 20.4.2010 Oznaka poročila: ARRS-RPROJ-ZP-2010-1/193 1 Samo za aplikativne projekte. Nazaj 2 Napišite kratko vsebinsko poročilo, kjer boste predstavili raziskovalno hipotezo in opis raziskovanja. Navedite ključne ugotovitve, znanstvena spoznanja ter rezultate in učinke raziskovalnega projekta. Največ 18.000 znakov vključno s presledki (približno tri strani, velikosti pisave 11). Nazaj 3 Realizacija raziskovalne hipoteze. Največ 3.000 znakov vključno s presledki (približno pol strani, velikosti pisave 11). Nazaj 4 Samo v primeru bistvenih odstopanj in sprememb od predvidenega programa raziskovalnega projekta, kot je bil zapisan v predlogu raziskovalnega projekta. Največ 3.000 znakov vključno s presledki (približno pol strani, velikosti pisave 11). Nazaj 5 Navedite največ pet najpomembnejših znanstvenih rezultatov projektne skupine, ki so nastali v času trajanja projekta v okviru raziskovalnega projekta, ki je predmet poročanja. Za vsak rezultat navedite naslov v slovenskem in angleškem jeziku (največ 150 znakov vključno s presledki), rezultat opišite (največ 600 znakov vključno s presledki) v slovenskem in angleškem jeziku, navedite, kje je objavljen (največ 500 znakov vključno s presledki), izberite ustrezno šifro tipa objave po Tipologiji dokumentov/del za vodenje bibliografij v sistemu COBISS ter napišite ustrezno COBISS.SI-ID številko bibliografske enote. Navedeni rezultati bodo objavljeni na spletni strani http://sicris.izum.si/. PRIMER (v slovenskem jeziku): Naslov: Regulacija delovanja beta-2 integrinskih receptorjev s katepsinom X; Opis: Cisteinske proteaze imajo pomembno vlogo pri nastanku in napredovanju raka. Zadnje študije kažejo njihovo povezanost s procesi celičnega signaliziranja in imunskega odziva. V tem znanstvenem članku smo prvi dokazali... (največ 600 znakov vključno s presledki) Objavljeno v: OBERMAJER, N., PREMZL, A., ZAVAŠNIK-BERGANT, T., TURK, B., KOS, J.. Carboxypeptidase cathepsin X mediates ß2 - integrin dependent adhesion of differentiated U-937 cells. Exp. Cell Res., 2006, 312, 2515-2527, JCR IF (2005): 4.148 Tipopologija: 1.01 - Izvirni znanstveni članek COBISS.SI-ID: 1920113 Nazaj 6 Navedite največ pet najpomembnejših družbeno-ekonomsko relevantnih rezultatov projektne skupine, ki so nastali v času trajanja projekta v okviru raziskovalnega projekta, ki je predmet poročanja. Za vsak rezultat navedite naslov (največ 150 znakov vključno s presledki), rezultat opišite (največ 600 znakov vključno s presledki), izberite ustrezen rezultat, ki je v Šifrantu raziskovalnih rezultatov in učinkov (Glej: http://www.arrs.gov.si/sl/gradivo/sifranti/sif-razisk- rezult.asp), navedite, kje je rezultat objavljen (največ 500 znakov vključno s presledki), izberite ustrezno šifro tipa objave po Tipologiji dokumentov/del za vodenje bibliografij v sistemu COBISS ter napišite ustrezno COBISS.SI-ID številko bibliografske enote. Navedeni rezultati bodo objavljeni na spletni strani http://sicris.izum.si/. Nazaj 7 Navedite rezultate raziskovalnega projekta v primeru, da katerega od rezultatov ni mogoče navesti v točkah 6 in 7 (npr. ker se ga v sistemu COBISS ne vodi). Največ 2.000 znakov vključno s presledki. Nazaj 8 Pomen raziskovalnih rezultatov za razvoj znanosti in za razvoj Slovenije bo objavljen na spletni strani: http://sicris.izum.si/ za posamezen projekt, ki je predmet poročanja. Nazaj 9 Največ 4.000 znakov vključno s presledki Nazaj 10 Največ 4.000 znakov vključno s presledki Nazaj 11 Rubrike izpolnite/prepišite skladno z obrazcem "Izjava sofinancerja" (http://www.arrs.gov.si/sl/progproj/rproj/gradivo/), ki ga mora izpolniti sofinancer. Podpisan obrazec "Izjava sofinancerja" pridobi in hrani nosilna raziskovalna organizacija - izvajalka projekta. Nazaj Obrazec: ARRS-RPROJ-ZP/2010 v1.00a FA-1B-80-2E-74-5A-E0-32-1B-90-19-AB-8B-89-05-85-9A-FC-A8-60